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微生物湿法冶金和微生物修复是解决低品位难处理矿产资源利用和污染治理的行之有效的方法。为了提高微生物作用的效率,就需要了解其中的微生物群落、浸矿微生物的功能基因以及开发利用这类环境中的高效微生物资源。而该类问题的解答目前主要依赖于分子生物学方法,如广泛应用的RFLP、Real-time PCR、基因芯片等,这些手段均需要以高质量的DNA或RNA为基础。目前,虽然针对环境样品DNA或RNA单独提取的方法有很多报道,同步提取的报道则很少,针对矿区样品DNA与RNA提取方法报道的更少,因而本研究针对矿区样品中微生物DNA与RNA提取和分离的方法进行探索。通过梯度实验优化提取环节中抽提缓冲液的pH、蛋白酶K量等条件以及分离环节中盐的选择、盐浓度、核酸浓度以及分离条件等。研究结果表明,当PIPES缓冲液pH为7.0,无蛋白酶K作用时所得多种浸矿菌的核酸质量均相对较好,而且所提DNA与所用菌量呈正相关(R=0.99),RNA量与所用菌量无相关关系；该方法能成功用于A.f,A.c,A.t,L.f,F.t等浸矿菌和环境样品的核酸同步提取,同时,当菌量达109时,提取所得的核酸量即可达DNA6.29±2.34μg RNA14.15±2.36μg。核酸分离研究结果表明,三种盐(NaCl,LiCl, CaCl2)中,LiCl的分离效果最优,其分离条件为,采用1/4体积的饱和氯化锂作用于浓度约为400ng/μL的核酸,经6-8小时的低温静置,通过离心即可分离DNA与RNA。经该方法提取与分离所得核酸的纯度较高,A260/280与A260/230值符合要求,260nm处有单吸收峰；DNA片段大于23kb,RNA有完整的16S和23S两条带,所提核酸成功的用于了基因克隆文库的构建和基因逆转录分析,研究结果表明,该核酸提取分离方法能够用于矿区样品的微生物分子生物学分析,并可以推广到其他样品中。