新三板作为中国多层次资本市场的重要组成部分，随着近年来扩容、做市和分层制度等各项政策红利，已成为专业投资者重要的投资方向。在新三板挂牌公司估值过程，投资者偏向于以可比上市公司的核心变量指标按相对价值法测算目标公司估值。该估值方法虽然简单，但却忽视了不同证券市场之间的差异，导致不同投资者对于相同股票价值的判断千差万别，进而影响投资决策和投资回报。　　新三板基于其交易制度、投资者门槛以及政策支持有限等原因，从挂牌公司层面到证券市场层面，均具有符合自身证券市场的特点。本文以相对价值法作为估值的理论基础，在新三板股票估值现实情况和理论假设的基础之上，确定了新三板股票与可比A股上市公司股票在市场流动性和预期增长率三方面差异上的修正依据、衡量标准和修正方法，并通过实证研究对修正方法进行验证。　　本文的研究成果可以为新三板专业投资者提供一套可操作性强、适用范围广的估值修正方法，用以判断新三板挂牌公司定向发行价格是否合理、是否符合自身的投资预期，避免作出错误的投资决策。而本文中所述的估值修正理论在实际应用过程中可以根据估值标的和投资者自身的实际情况进行调整。若证券市场中多数投资者均能够使用统一的估值修正理论作为投资决策的参考依据，将有利于有效缩小新三板市场买卖差价，减少证券市场流动性的不必要损失，并起到撮合交易的效果。