巴西橡胶树遗传图谱第8、9号连锁群18个遗传标记的物理定位

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巴西橡胶树属于大戟科橡胶树属,是一种多年生的热带作物。本研究是以巴西橡胶树热研’7-33-97’品种为材料,利用荧光原位杂交技术或者原位PCR技术对Lespinasse等(2000)构建的巴西橡胶树遗传连锁图中的2个连锁群上18个标记位点进行了物理定位,并将这些标记位点在连锁群上的位置与在染色体上的位置进行整合。这不仅可为构建完整的橡胶树分子细胞遗传图谱奠定基础,还可为橡胶树分子辅助育种、种质资源鉴定和比较基因组学等研究提供有力的科学依据。本研究所得的具体结果如下:(1)从Lespinasse等(2000)构建的巴西橡胶树遗传图谱中第8号和9号连锁群上共选取18个遗传标记,其中包含16个RFLP标记位点和2个SSR标记位点。(2)对 8 号连锁群上的 gHbCIR504.RO、gHbCIR678、gHbCIR236、gHbCIR498.RO、gHbCIR692、gHbCIR498.PB、M197、gHbCIR83、gHbCIR643、M630和gHbCIR358等11个遗传标记位点进行了荧光原位杂交检测。核型整合分析结果可知,这11个遗传标记均位于热研’7-33-97’品种的第5号染色体上。其中gHbCIR504.RO和gHbCIR236两个标记位于5号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别为 73.95 和 25.67;gHbCIR678、gHbCIR498.RO、gHbCIR692、gHbCIR498.PB、M197、gHbCIR83、gHbCIR643、M630 和 gHbCIR358 等 9 个标记位于第5号染色体长臂上,信号位点到着丝粒的百分距离依次为13.82、18.60、19.17、28.61、35.07、49.61、58.95、69.95和74.93,由此可知,第8号连锁群与巴西橡胶树热研‘7-33-97’的第5号染色体对应,并构建了 5号染色体的细胞遗传图谱。(3)对 9 号连锁群上 gHbCIR568、gHbCIR184、gHbCIR95/331、gHbCIR280、gHbCIR666.L2、gHbCIR257 和 gHbCIR380 等 7 个遗传标记中 gHbCIR184 和gHbCIR257两个遗传标记进行原位PCR检测,gHbCIR568、gHbCIR95/331、gHbCIR280、gHbCIR666.L2和gHbCIR380五个遗传标记进行荧光原位杂交检测。核型整合分析结果得知,9号连锁群上7个遗传标记均位于热研’7-33-97’的第1号染色体上。gHbCIR568和gHbCIR184两个遗传标记定位在第1号染色体短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别为35.78和25.20;而gHbCIR95/331、gHbCIR280、gHbCIR666.L2、gHbCIR257和gHbCIR380等5个标记定位在1号染色体长臂上,信号位点到着丝粒的百分距离依次为21.33、31.35、46.40、47.78和57.77。由此可知,第9号连锁群和巴西橡胶树热研’7-33-97’的第1号染色体对应,并构建了 1号染色体的细胞遗传图谱。
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