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研究目的:
从2002年H3N2流感获得NA基因,构建入pCI—neo载体,制备DNA疫苗,对进行序列分析,探讨其分子进化关系,为研究流感DNA疫苗奠定基础。
研究方法:
从2002年流行流感患者分离甲型流感病毒,鉴定病毒分离株,病毒经9~11龄的鸡胚和MDCK细胞培养增殖,-70℃保存提取流感病毒RNA,设计引物进行NA基因RT-PCR,将特异性PCR产物克隆到T—vector,进行序列测定和分析。并将基因亚克隆到真核表达载体pCI—neo,利用生物信息学技术对H3N2型流感病毒的NA基因进行了同源性比较和进化分析。
研究结果:
鉴定病毒分离株为A/Guangdong/236/2002/H3N2,A/Guangdong/068/2002/H3N2,A/Guangdong/448/2002/H3N2,A/Guangdong/027/2002/H3N2.获得一个核苷酸长度为1410bp的基因编码469个氨基酸H3N2病毒NA基因,构建了真核表达载体,转染COS-7细胞。1968—1975年毒株与2000年后毒株变异较大,2000年之后毒株变异较小。NA基因776位点,本课题研究毒株2002广东株发生了独特的变异,由A→G。在1185位点,本课题研究毒株2002广东株和1998年广东株发生了独特的变异(A→G),有地域特征。2000年以后毒株发生稳定变异的氨基酸位点有18,23,30,42,93,127,143,208,216,249,265,267,307,339,344,346,369,385,437。2004年以来的毒株199位由E突变回1988年以前毒株K,432位由Q突变回1984年以前毒株E。385位1992年以前毒抹为T,之后到2001年毒株突变为K,2002年以来毒株为N,对于毒株适应选择压力有重要意义。
结论:
1.由H3N2流感病毒株中得到了NA基因编码区cDNA序列,序列分析正确,成功构建了其真核表达载体,为进一步研究其免疫功能奠定了基础。
2.1968年以来中国H3N2流感病毒NA基因进化主要分为三个阶段,第一个阶段从1968年到20世纪90年代初,第二个阶段从20世纪90年代初到20世纪90年代中期,第三个阶段从20世纪90年代末到目前21世纪初期。基本上呈时间进化关系,地域差别不明显。90年代中期处于新旧毒株进化交替时期,每隔约9年有一次基因返祖现象。