家禽是人类重要的食物来源,家禽的健康状况与人类息息相关,Sicinivirus是微RNA病毒科Sicinivirus属病毒,目前的相关研究较少。该病毒可能和其他的肠道病毒共同感染导致腹泻和并发症,例如鸡的发育迟缓综合征、腹泻和吸收不良综合征。Sicinivirus属的第一个成员,由Susan Bullman等于2014年从爱尔兰的商品肉鸡的粪便中首次被检测到,因sicini是盖尔语的“鸡”一词,故命名为Sicinivirus,对该病毒的基因组分析表明,其属于微RNA病毒科,病毒基因组是单链正向RNA,是目前为止报道的基因组最大的微RNA病毒之一。本实验使用针对Sicinivirus病毒3D保守区设计的一对引物对来自我国2019年下半年8个省份的1920份咽肛拭子样品进行检测和数据统计,调查了我国部分省份的流行状况,结果表明,在1920份样品中检出134份阳性样品,Sicinivirus的总体阳性率为6.97%(134/1920)。在被检测的鸡、鸭、鹅、鸽和鹧鸪五种禽类中,检出鸡阳性样品132例、鹅和鸽各1例、鸭和鹧鸪未检出Sicinivirus,鸡、鹅和鸽的感染率分别为10.81%(132/1221)、2.5%(1/41)、0.4%(1/245)。在农贸市场、批发市场、屠宰场和养殖场感染率分别为3%(18/600)、6.23%(58/930)、24.16%(58/240)、0.00%(0/150)。使用高通量测序的方法,对在我国检到的Sicinivirus毒株NX038的基因组进行测序,并进行基因进化分析,该病毒株与江苏株ch/JSY/China/2014的进化关系最近,与香港株ch/100C/Hong Kong/2009较为接近。