TMEM39A、FYB、UBASH3A基因多态性与中国汉族人群SLE相关性研究

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研究背景系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus, SLE)是一种典型的自身免疫性疾病,临床表现复杂多变,与遗传、种族和环境等各种因素有关。近年随着国际人类基因组单体型图计划(HapMap)的完成和高通量基因分型技术的发展,使得全基因组关联分析研究(GWAS)在寻找SLE易感基因方面有很大突破,发现很多与SLE有关的变异基因,并且很多团队进一步深入研究这些基因与SLE临床表型之间的相关性。目前为止,全基因组关联分析研究已经确认40多个与SLE相关的疾病易感的基因位点。国外有研究团队已经证明TMEM39A(rs1132200)、FYB(rs358501)和UBASH3A(rs9976767)与SLE有关。目的验证TMEM39A(rs1132200)、FYB(rs358501)和UBASH3A(rs9976767)与中国汉族人群SLE发病是否有关,还更深一步研究TMEM39A(rs1132200)、FYB(rs358501)和UBASH3A(rs9976767)多态性与SLE患者临床表型(发病年龄,抗RNP抗体,盘状红斑,血液学异常,抗SM抗体,蝶形红斑,口腔溃疡,神经系统异常,关节炎,光敏感,浆膜炎,肾脏病变,免疫学异常,抗核抗体和血管炎)的相关性,进一步阐明系统性红斑狼疮的发病机制,找出其病因学,给发现新的靶向疗法带来希望。方法1.2208例SLE正常对照与2208例病例用Sequenom MassArray基因分型系统进行分型,分析得出数据,最后再用Plink1.06软件进行数据统计分析结果。2.基因型-表型关联分析时,首先进行病例-病例(如抗RNP抗体阳性的患者和抗RNP抗体阴性的患者)分析确定哪些临床表型可能与SNPs位点有相关性,再进行病例-对照(如抗RNP抗体阳性的患者/抗RNP抗体阴性的患者与正常对照)分析进一步确定在不同的临床表型中SNPs位点所贡献的风险大小。本次研究主要分析风险等位基因和ACR(美国风湿病学会)在1997年确定的系统性红斑狼疮分类准则中的11项临床表型、血管炎与发病年龄之间等之间的关系。最后用SPSS20软件进行统计分析,计算出P, OR,95%CI,其中P <0.05时被认为有统计学意义。结果1.病例组和对照组等位基因分型中TMEM39A(rs1132200,P=0.009094,OR=0.8108,95%CI=0.69-0.95), FYB (rs358501,p=0.2402,OR=1.054,95%CI=0.97-1.15),UBASH3A(rs9976767, P=0.9014, OR=1.006,95%CI=0.92-1.10),其中只有TMEM39A有统计学意义。2.基因型-表型分型:TMEM39A与RNP抗体(OR=1.34, P=0.04)相关。结论1.TMEM39A与中国汉族人群SLE易感性相关,而FYB、UBASH3A则于SLE易感性无关。2. TMEM39A可能与RNP抗体相关。
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