近年来,随着我国经济发展,社会进步,国家法律体系日趋完善,人们在医疗服务中的维权意识逐渐增强,加之我国医疗保障体系尚不健全,医患纠纷调处机制不甚完善,医患矛盾日益凸显,行政机关如何治理医患关系,成为了构建和谐社会的一个重要课题。在医患关系的行政治理中,行政机关对医疗机构违法行为监管不力;医疗卫生行政复议运行中的问题;医疗纠纷调处机制不完善,对医疗事故的行政调解失败率高,这些都是行政机关在治理医患关系中所遇到的问题。本文以医患关系的行政治理为研究对象,首先分析了医患关系的含义,医患关系行政治理的主要方式及法律依据、优越性及现实意义;进而通过三个典型案例揭示出医患关系行政治理中存在的问题并深刻的挖掘了产生问题的原因;最后对如何更好的治理医患关系提出了一些建议。通过完善相关立法明确复议机关、完善复议程序,宣传法律知识三个方面来解决医疗卫生行政复议制度运行中的问题;从完善监管程序、加强对行政机关的监督、提高监管人员法律意识三个方面来完善监管体系,提高监管效能;从构建专门调解机构、加强对患者疏导沟通、完善立法三个方面来提升行政调解的成功率和实效性。