近年来,桃细菌性穿孔病已经上升为我国桃树上的主要病害之一,严重威胁桃产业的健康发展。目前关于该病的病原种群结构、流行学及防控措施等均研究较少,增加了该病害的防控难度。本研究从我国主要桃产区进行了病样采集、病原菌分离及鉴定,明确了引起我国桃细菌性穿孔病的病原。通过rep-PCR和ISSR-PCR分子标记解析病原菌群体遗传多样性,开发出相应的病害早期检测技术,同时开展了田间防治试验,为桃细菌性穿孔病防控提供理论依据和实际指导。主要研究结果如下:（1）从我国主要桃产区12省17市共分离到675株细菌,通过16S r DNA序列分析主要鉴定到14.5%Xanthomonas species和84%Pantoea species两类细菌;对两类细菌进行柯赫氏法则验证,表明Xanthomonas species细菌能引起典型的穿孔症状,为桃细菌性穿孔病的致病菌;对Xanthomonas species细菌进行形态学观察、Biolog微生物系统表型鉴定、ftsx基因PCR专化性鉴定以及多基因联合系统发育分析,98株Xanthomonas species细菌全部被鉴定为Xanthomonas arboricola pv.pruni（Xap）。因此,明确了引起我国桃细菌性穿孔病的病原菌为Xap。（2）通过rep-PCR和ISSR-PCR标记分析Xap病菌群体遗传多样性。结果表明,多态性百分比PPL为80.99%,遗传分化系数Gst为0.5626,基因流Nm为0.3888,预示Xap种群内部具有丰富的遗传变异。基于NJ聚类图、Pco A主成分分析、STRUTURE遗传结构分析等系统发育分析表明我国Xap群体内部相似性较高（65%）,但不同地理种群之间存在明显的遗传分化（HBZY和HBJM种群）。基于DAPC判别分析、AMOVA分子变异分析等类群分析表明不同寄主来源（核桃、桃和李）X.arboricola之间存在明显的寄主专化性,但不同地理来源的Xap内部专化性较弱,变异主要存在于种群内（56%）。（3）建立基于RPA/Cas12a系统的Xap检测方法。选择Xap专化性基因ftsx为本检测技术的候选靶标,设计3对RPA引物测试反应专化性,结果表明RPA1F/RPA1R引物能够稳定且专一地检测出Xap,可用于后续RPA反应。基于RPA1F/RPA1R引物的靶向区域设计了3个crRNA进行Cas12a裂解反应,结果显示crRNA2能够稳定地引导Cas12a降解靶向ds DNA和非专化性ss DNA,可用于后续裂解反应。设计两种不同形式的报告探针实现可视化检测,即FQ-reporter介导的荧光信号和FB-reporter介导的横向流动检测试纸条。其中,基于FQ-reporter荧光报告探针的核酸检测通过微型紫外手电筒实现可视化,其检测灵敏度低至10-18M（8.855fg/μL）Xap基因组DNA;基于FB-reporter的生物素探针检测通过试纸条实现可视化,灵敏度可达10-17M（88.55fg/μL）Xap基因组DNA。专化性评价显示2种检测方法均能够从常见桃树病原菌DNA及与Xap相似度较高的其他杂菌中专化性地检测出Xap。最后,将该技术与基于Na OH溶液的DNA粗提取（3 min）相结合,进一步简化出从叶片病斑到诊断结果的一体化检测程序。对人工接种发病叶片及自然发病的穿孔叶片检测结果表明,简化的检测方法仍能准确、高效地检出阳性结果,且整个过程只需要37℃孵育1 h左右,不依赖任何复杂仪器。综上,本研究开发出了一种灵活、有效、简便的Xap检测方法,有望广泛应用于田间桃细菌性穿孔病的早期诊断及监测。（4）结合室内抑菌活性测定和2年2试验地的平行重复田间试验,明确了可杀得对桃细菌性穿孔病具有最优的防治效果。倍数稀释为1:800时,防效可达90%以上,倍数稀释为1:2000时防效也可达70%以上,并且使用倍数稀释为1:2000时基本可消除Cu2+积累带来的植物毒性,在田间可以使用。抗生素类杀菌剂在室内显示很高的杀菌活性(EC50=0.04-2.06μg/m L),但田间使用效果不稳定（2019-2020年荆门）,仅能够起到延缓病情发展的作用。总体上,保护性杀菌剂可杀得、代森锰锌等比治疗性杀菌剂中生菌素等防治效果好。