南京市春季三个功能区大气微生物群落结构PCR-RFLP分析

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微生物是城市生态系统重要的生物组成部分,有着极其重要的生态系统功能和作用,城市生态系统中大气微生物影响城市空气质量和人体健康也密切相关。微生物在空气的降尘中获得营养物质,从而大量增殖,并随降尘迁移,成为病原微生物传播的一个可能途径。生活在大气中的微生物种类多,可能参与二氧化碳的固定,在全球碳素循环中具有潜在的生态功能。本课题以南京市几个城市功能区为典型研究区域,采用培养方法结合PCR-RFLP分析方法明确大气环境中的细菌、真菌微生物数量与种类;重点对固定二氧化碳的关键酶RubisCO的基因cbbL的多样性进行了分析,为二氧化碳固定微生物固定提供一个新的研究思路。通过使用空气采样器采样,采用PCR-RFLP勺方法对南京市三个不同功能区(NAU, NBG, XWG)6勺空气进行取样和分析。本研究着重研究了南京市春季空气中细菌群落多样性。挑取305个OTU用两种限制性内切酶Hha Ⅰ和Xsp Ⅰ酶切,结果表明,南京市春季细菌种类丰富,液体微生物采样器能够更好的对空气中的细菌进行采集。测序结果表明,3个属的细菌在南京市春季细菌群落中占有一定优势,分别为微球菌属(Micrococcus),芽孢杆菌属(Bacillus),假单孢菌属(Pseudomona)。通过可培养方式对南京市空气中的真菌进行培养。然后采用PCR-RFLP的方法对其群落多样性进行分析,研究结果发现南京市春季的空气中真菌的数量可达104CFU/m3。链格菌属(Alternaria),青霉属(Penicillium),曲霉属(Aspergillus),肉片齿菌属(Sistotrema)是春季南京空气中的常见菌属。通过基因克隆建立功能基因cbbL文库、PCR-RFLP和测序分析微生物固定二氧化碳的关键酶基因cbbL的分子多样性。通过构建系统发育树发现,来自大气样品的氨基酸序列与噬氢菌属(Hydrogenophaga)及绿藻门的胶球藻属(Coccomyxa)勺同源性较高,推测绿藻门及噬氢菌属的生物是空气中通过卡尔文循环固定二氧化碳的生物类群。
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