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畜禽遗传资源及其多样性是畜牧业可持续发展的种质基础,是满足未来市场需求的重要基因库。我国家禽品种资源丰富,但近年来受到外来引进鸡种的冲击,加上人们对地方鸡种资源的保护意识淡薄,导致我国地方鸡种遗传资源日益贫乏。对家禽遗传资源多样性的研究有助于弄清品种资源的现状和特色,为品种资源的保护和合理开发利用打下良好基础。联合国粮农组织(FAO)将微卫星标记列为进行动物遗传资源研究的首选标记,本研究参照AVIANDIV PROJECT推荐的26个微卫星位点对6个湖北地方鸡群体的遗传多样性进行研究,目的是了解它们的分子种质特性,为湖北地方品种鸡保种和开发利用积累基础数据。主要研究结果如下: 1.计算了26个微卫星位点中各位点在不同鸡群中的等位基因频率,共检测到352个等位基因,每个座位平均13.5385个。在6个湖北地方鸡群体中各位点等位基因数目和频率不同程度的显示出差异。 2.计算了各群体的杂合度、多态信息含量和有效等位基因数三个参数,比较了各群体内的遗传差异。6个湖北地方鸡群体的平均群体杂合度为0.5307(0.4624-0.5753),有效等位基因数范围在5.6647-6.7738之间,平均多态信息含量范围为0.7806-0.8240,群体内的遗传变异从大到小排序为:郧阳大鸡、洪山鸡、郧阳白羽乌鸡、双莲鸡、江汉鸡、荆门黑羽绿壳蛋鸡。 3.计算了总群体杂合度(HT)、亚群体杂合度和遗传分化系数(GST),结果表明群体间的遗传变异不大(群体间的差异仅为3%),群体遗传变异主要来自于群体内。 4.计算了各群体间的Nei氏遗传距离,荆门黑羽绿壳蛋鸡与双莲鸡的遗传距离最大,郧阳乌鸡与江汉鸡的遗传距离最小,遗传距离范围在0.1445—0.3220之间。 5.根据Nei氏遗传距离进行了UPGMA聚类,6个鸡群被聚为2:Ⅰ类为郧阳大鸡与双莲鸡聚为一类;Ⅱ类为郧阳乌鸡、江汉鸡先聚在一起,然后又与洪山鸡聚在一起,最后再与荆门黑羽壳蛋鸡聚为一类。