大学是传播先进文化、实现科研创新、促进社会发展的基地。政府有着依法对国家政治、经济和社会公共事务进行管理的职能。社会中的成员通过长期合作,发展形成了不同组织关系的团体。大学治理的运行机制是围绕政府、社会、大学三个基本要素间的关系与作用展开的。对大学、政府、社会之间动态而复杂的关系探讨,一直是大学治理研究中的重要问题。本研究从经济学和管理学的经典理论着手,通过对治理理论、法人理论、利益相关者理论、人力资本理论、博弈论和成本分担理论的梳理,将其应用于大学治理中各角色作用的分析上。借此明晰政府、社会在大学治理中的作用方式,以及各方的权、责、利。并通过分析各主体自身存在的局限性,提出其参与大学治理所面临的问题。针对现存的问题和不足,根据委托代理理论和管家理论提出约束机制和激励机制。通过约束机制可以有效地防止滥用职权、不作为、单独接触等一系列违规行为的产生,避免脱离监督所造成的损害某些利益相关者的行为。激励机制则是利用需要层次理论对大学治理中各利益相关者的需要予以一定程度的承诺和满足,使其能够自发的参与大学治理,强化主体的内在动机,从而更好地使大学治理的目标得以实现。