改革开放以来，我国农业借助制度创新和结构调整得到了迅猛的发展，但是进入20世纪90年代以后，前者的推动作用开始减弱，农业增长逐渐放缓，实现农业现代化阻力重重。此时，用农业高新技术改造传统农业，实现农业高新技术产业化，是增强我国农业素质，提高农业竞争力，促进我国农业农村发展的重要途径。 我国从20世纪80年代开始重视以生物技术为主的农业高新技术的发展，采取各种措施，积极支持促进我国农业高新技术的现实生产力转化和产业化发展，取得了显著的成绩。但是，我国农业高新技术产业化由于起步迟、基础差，在发展过程中暴露了很多问题。笔者认为，这些问题的原因除了既有体制的固有弊端和一些客观条件的制约外，关键在于市场运行机制不完善。 本文从完善市场运行机制角度入手，探讨解决阻碍我国农业高新技术产业化快速健康发展的问题。本文综合运用经济学、组织行为学等学科的知识，理论与实践相结合，采用系统分析法、比较分析法、典型调查法等研究方法，阐述了农业高新技术产业化的内涵和特点，介绍了国内外农业高新技术产业化发展现状，总结归纳了国外积极的政策助推机制、高效的官产学协力机制、合理的科技投入机制、明确的企业研发转化主体、灵活的人才机制以及精明的领域定位六个方面的成功经验，深入分析我国农业高新技术产业化存在的几个主要问题：科研创新不顺畅、创新主体弱化、资金不足、人才短缺、技术中介转移不力等，分析探讨了建立完善的农业高新技术产业化的市场运行机制的理论依据和运行模式，结合我国的具体国情，重点提出要全面构建高效完善的农业高新技术产业化市场运行机制，需要进一步改革完善我国的农业科技体制、建立完善农业技术中介转移机制以及产业化的投融资机制，并就完善我国农业高新技术产业化主要模式之一的农业科技园区运行机制进行了探讨。