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淇河鲫(Carassius auratus in Qihe River)属鲤形目(Cypriniformes),鲤科(Cyprinidae) ,鲫属(Carassius Jarocki) ,产于河南淇河,是天然三倍体雌核发育鲫鱼。淇河鲫生长快、味道美、效益高,具有良好的开发前景。因淇河鲫这些独特的特性,对淇河鲫分子遗传学和进化遗传学等方面的研究成为众多学者感兴趣的课题。本研究利用ISSR和Cytb技术对淇河鲫和其他野生鲫鱼群体进行遗传多样性和遗传距离的分析,旨在探讨淇河鲫的遗传进化和其他近缘种的亲缘关系。以期为淇河鲫的种质资源和遗传育种提供理论依据。1.淇河鲫和2野生鲫鱼群体遗传多样性的ISSR分析应用ISSR技术对淇河鲫、金堤河鲫、沁河鲫3个群体进行遗传多样性研究。结果表明:(1)筛选8个引物共得到94个扩增位点,其中多态位点82个,多态位点百分率87.23%。(2)Popgene分析结果,淇河鲫群体的遗传多样性水平相对较低,PPB=61.70%,H=0.2036,I=0.3085。(3)3鲫鱼群体间的遗传分化系数GST=0.1303,基因流Nm=3.3359。表明3个鲫鱼群体的遗传分化尚未达到种群的分化水平。(4)金堤河鲫和沁河鲫群体间遗传距离较近,淇河鲫有一定的遗传分化,形成了较稳定的、独立的遗传结构。2.淇河鲫和8野生鲫鱼群体及其近缘物种鲫鱼的Cytb遗传分析用细胞色素b(Cytb)基因特异性引物,对淇河鲫和另外8种野生鲫鱼群体的线粒体Cytb基因进行PCR扩增和双向测序。9种鲫鱼群体均得到序列一致的Cytb基因全序列,长度约为1140bp。除九鲤湖鲫和大塘港鲫外,淇河鲫与另6群体鲫鱼的Cytb基因序列几乎没有发生变异。淇河鲫T、C、A、G的含量分别为29.1%、27.9%、28.6%和14.4%,A+T的含量(57.7%)明显高于G+C的含量(42.3%),除九鲤湖鲫外,淇河鲫与8群体鲫鱼Cytb基因序列的碱基组成相差不大。淇河鲫Cytb基因序列显示出较明显的碱基偏倚,其中G的含量较低,在Cytb基因全序列中仅占14.4%,在密码子的第1位上仅为9.3%,其次是第3位点为14.0%,第2位点基本不偏倚,另8群体也表现出这一特征。邻接法构建的分子进化系统树表明,淇河鲫与普通鲫鱼的亲缘关系最近,与萍乡肉红鲫的距离次之,与日本银鲫、希腊银鲫、日本兰氏鲫和捷克兰氏鲫的距离较远,与黑鲫的距离最远。