最典型的腔光机械系统是由一个光学谐振腔和一个机械振子组成,这一结构不仅使得腔光机械系统将光学自由度和力学自由度耦合在一起,实现光场与机械振子间的彼此调节；而且在特定的条件下,光场的量子特性可以通过介观的机械振子体现出来,从而实现宏观物体量子行为的观测与研究。因此,腔光机械系统在基础量子力学、量子通讯及光信号精密探测等方面的研究中具有十分重要的意义。腔光机械系统的一个显著的优势在于,为物质与光场的相互作用提供了一个良好的平台,使得以原子、电子及量子点为代表的一些辅助系统能够很容易的被引入到腔光机械系统中。其中,原子介质的参与能够有效地提高光场和机械振子间非线性耦合,这有利于研究腔光机械系统的一些量子特性,如电磁诱导透明、机械振子的压缩态、纠缠态的制备等。本文主要研究了含有原子的混合腔光机械系统的量子纠缠与电磁诱导透明现象。以量子朗之万方程、输入输出理论为主要研究工具,我们提出了利用单个四能级原子耦合双模动腔制备多体纠缠态的理论方案。受经典场驱动的单个四能级原子会诱导两个移动镜子、两模腔场以及镜子与腔场之间的纠缠；同时,四能级原子不能忽略的低能级差使得两个镜子之间的介观纠缠和腔场的输出压缩谱都出现了劈裂的现象。含有原子的腔光机械系统不仅能够产生介观纠缠,也能展示出类似的多电磁诱导透明现象。我们研究了二能级原子系综耦合一个环形腔光机械系统(包括两个声子模)产生的多电磁诱导透明现象,讨论了原子的衰减率对透明窗口个数及窗口宽度的影响。此外我们还研究了多个机械模二次耦合同一个腔场的情况,发现即使机械模的振动频率相同,仍然会出现多个透明窗口。本论文的这些研究有助于对混合腔光机械系统中非线性光学效应的理解。从而对这一非线性光学系统用于精密测量等方面的研究起到一定的积极作用,具有一定的参考价值。