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目的：利用深度测序技术探究肿瘤形成过程中相关的遗传改变,希望找到与肝内胆管癌形成和进展相关的体细胞突变基因,为研究肝内胆管癌病因,探寻合适的肿瘤诊断标记物及治疗靶点提供更多理论依据。方法：①收集中国人民解放军总医院肝胆外科2014年5月至2014年12月经手术治疗的5例肝内胆管癌患者癌组织及相应癌旁组织,进行外显子组捕获测序,经生物信息学分析后挑选出候选基因。②收集来自中国人民解放军总医院肝胆外科2014年5月-2015年9月的肝内胆管癌手术切除49例癌组织以及对应癌旁肝组织（含以上高通量测序标本）,其中肝外转移组15例,非转移组34例。设计引物,PCR扩增目的片段后进行Sanger测序,验证深度测序结果,比较转移组与非转移组中目的基因突变率差异。③采集中国人民解放军总医院病理科保存的2015年9月至2016年1月肝内胆管癌术后标本制成的蜡块,癌组织及对应癌旁组织各36例。采用免疫组化的方法观察USP17蛋白表达水平在癌组织与癌旁组织,及癌组织转移组与非转移组当中的差异。结果：经过对5对样本的深度测序及生物信息学分析,筛选出USP17L10.SPDYE1、 LRRC37A3、SIMC1、TPSD1、PRAMEF18、TBC1D3G、OBSCN等在肝内胆管癌中新发现的8个基因的12个SNV位点作为候选突变基因位点。扩大样本量行Sanger测序发现在49例肝内胆管癌组织DNA中发现7例发生了与深度测序突变位点相同的USP17L10点突变,突变频率为14.3%,即在4号染色体基因组9213473位置（该基因序列1091位置,NM001256852.1）发生G>C点突变,为错义突变,AGT-→ACT,丝氨酸变为苏氨酸,杂合子突变型。癌旁组织未见该突变。7例突变标本中5例发生在15例转移组中（33.3%）,2例发生在34非转移组中（5.9%）,转移组与非转移组的突变率有统计学显著性差异（P<0.05）。免疫组化显示36例肝内胆管癌组织中存在16例USP17阳性（44.4%）,36例癌旁组织中5例阳性（13.9%）,且两者阳性率有统计学显著性差异（P<0.05）。16例阳性癌组织中,6例属转移组,10例为非转移组,两者阳性率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:USP17基因突变可能与肝内胆管癌发生发展相关,并与肿瘤的肝外转移关联。USP17蛋白在癌组织中的表达水平高于癌旁组织。USP17基因突变在肝内胆管癌中的作用机制尚有待进一步深入研究。