西葫芦白粉病抗病基因精细定位及候选基因分析

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西葫芦(Cucurbita pepo L.)为葫芦科南瓜属重要的蔬菜作物。白粉病在瓜类作物中流行性强,发病普遍,对西葫芦田间生产常常造成严重产量损失,是影响西葫芦种植效益的主要病害之一。培育抗病品种是防治白粉病最为经济有效的手段,也是西葫芦育种研究的主要目标之一。但是,目前浸染西葫芦的白粉病生理小种多,西葫芦缺乏免疫抗性的育种材料,对西葫芦白粉病抗性的研究少等问题导致抗病新品种的培育效率低,市场上抗病品种少。本研究拟在前期初步对西葫芦白粉病抗病基因定位的基础上,利用重测序技术结合BC6F2群体对抗病基因进行精细定位,并对候选基因进行预测、克隆及白粉病诱导表达分析。这些研究结果对拓宽该抗病基因的育种应用,提高抗病新品种培育效率,减少农药施用,增加种植效益以及解析抗病分子机理均具有重要意义。主要研究结果如下:1、抗、感亲本重测序获得高质量序列信息对定位群体BC6F2的抗病亲本63-32(P1)和感病亲本自交系葫8父(P2)进行高通量重测序,以西葫芦基因组序列为参考基因组,测序后分别获得9.8Gb和8.5Gb的序列,对初定位区域进行了序列拼接,获得4.7 Mb的精细序列。经亲本间序列差异分析,获得In Del位点4256个,SNP位点12330个。2、利用重测序筛查获得的分子标记结合BC6F2群体将抗病基因精细定位在157 Kb的区域内利用双亲重测序获得的多态性分子标记筛查193株BC6F2抗性分离群体,将抗病基因逐步精细定位于第10染色体的分子标记836与356之间,该区域包含157 Kb的序列。3、候选抗病基因预测及白粉病诱导表达分析结合西葫芦全基因组基因注释信息分析,精细定位区域包含有32个编码基因,其中基因chr10-29具有抗病相关功能,可能为候选抗病基因。该基因chr10-29区域在抗、感亲本间存在序列差异,导致编码蛋白改变。组织表达谱分析结果表明,该基因在茎干及叶中表达;经白粉病接种诱导后18h在抗病亲本中表达量明显升高。4、利用与抗病性状共分离分子标记进行标记辅助选择育种利用获得的与白粉病抗性共分离的分子标记023进行标记辅助选择育种,结合回交转育培育抗病西葫芦自交系,经过对5000余株的单株苗期筛选,田间种植观察植株白粉病抗性性状与分子标记筛选结果一致,该标记可以应用于标记辅助育种,提高育种效率。
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