牛樟芝是一种珍稀的药食两用真菌。目前牛樟芝菌丝体的人工培养方式主要是固态发酵和液态发酵,而泛醌类衍生物Antroquinonol和马来酸琥珀酸衍生物Antrodin C是牛樟芝菌丝体中具有显著生理活性的特征性代谢产物,但目前仍处于较为基础的研究阶段。因此,本论文以固态发酵产Antroquinonol和以液态发酵产Antrodin C为主要研究对象,针对两者所存在的部分问题开展进一步的研究。在固态发酵研究中,以Antroquinonol为主的研究大多在确定一种固态基质后对发酵工艺进行优化,然而目前其产量仍较低,而且对于不同基质影响Antroquinonol合成的原因也鲜有探讨。基于此,本实验首先选取10种不同的基质进行固态发酵,结合谷类基质的直链淀粉含量和颗粒度对所选基质可促进Antroquinonol合成的机理进行初步解释,随后在单因素实验的基础上,设计了三因素三水平的响应面实验。结果表明,在小米100 g,大豆水解液82.4 mL·L^-1,初始含水量41%,接种量21 mL·100g^-1基质,发酵25天的条件下,Antroquinonol的产量为1340.7 mg·kg^-1,是未优化前(325.0 mg·kg^-1)的4.1倍。而在液态发酵中,以Antrodin C为主的研究虽可以通过添加萃取剂等方式提高Antrodin C的产量,但仍存在Antrodin C分离纯化困难、萃取剂难以回收利用、使用成本较高以及产量依旧较低等问题。因此,另外寻求一种可直接促进Antrodin C合成的调控方式显得尤为重要。本论文通过对Antrodin C的抗氧化性分析发现其具有较好的抗氧化性质,推测其可能参与胞内ROS调控过程相关。为证明此推测,在牛樟芝液态发酵过程施加氧化胁迫,促使菌丝体产生ROS,同时研究该过程对Antrodin C合成的影响规律。结果表明所选取的三种氧化胁迫剂均对Antrodin C的合成有促进作用,其中过氧化氢为最佳的氧化胁迫剂,在最佳的浓度和添加时间下,Antrodin C的产量达375.20 mg·L^-1,是对照组的5倍。除此之外,过氧化氢的加入使得胞内CAT酶活提高了1.37倍,而添加了ROS清除剂会导致Antrodin C的产量下降,这进一步证明Antrodin C的产生与胞内ROS的水平有关。随后对ROS诱导下的牛樟芝液态发酵条件进行优化。首先对碳氮源、培养温度以及初始pH进行筛选,进而设计三因素三水平的响应面优化实验,在过氧化氢浓度为25 mmol·L^-1,培养温度为24℃,初始pH为7时,Antrodin C的产量为605.12 mg·L^-1,是对照组的8.06倍,达到了较高的水平。最后为了进一步探究ROS诱导Antrodin C产生的机理,采用转录组学进行初步分析。结果发现添加过氧化氢的条件下,线粒体电子传递链中复合物酶系的调控基因表达量较对照组有大幅下调,由此推测过氧化氢的加入可能会导致电子传递链效率降低,打破菌丝体胞内ROS的平衡,从而促使Antrodin C的合成。为验证该结果,在发酵过程中添加电子传递链抑制剂鱼藤酮,结果表明,电子传递链被抑制后的确会促使Antrodin C的合成,这也为进一步阐明Antrodin C的合成机理奠定了一定的理论基础。