NLR基因多态性与Behcet病和VKH综合征的相关性研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ws1984003
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背景:Nod样受体(Nod-like receptor,NLR)是胞浆型模式识别受体,在机体识别抗原等多种免疫应答中发挥重要作用。其中多个NLR成员(NOD1、NOD2、NLRP1、NLRP3、NLRP5和CIITA)基因多态性被证明与多种免疫性疾病相关。Vogt-小柳-原田综合征(Vogt-Koyanagi-Harada syndrome,VKH)和白塞氏病(Behcet’s disease,BD)是在亚洲人群中常见的两种葡萄膜炎,虽然发病机制尚不清楚,但多项研究表明免疫反应和遗传因素共同影响两种疾病的发生发展。近期研究已发现多个基因与BD和VKH综合征相关联。目的:此项研究旨在探讨在中国汉族人群中,6个NLR基因(NOD1,NOD2,NLRP1,NLRP3,NLRP5和CIITA)的多态性与BD和VKH综合征的相关性。方法:根据文献报道和本实验室关于VKH综合征的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)结果,我们选择了位于NLR基因上的20个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,即NOD1//(rs2075818,rs2907748,rs2907749),nod2//(rs8057431,rs3135499),nlrp1//(rs6502867,rs878329,rs12150220,rs8079034),nlrp3//(rs10754558,rs10925019,rs4925648,rs3806265,rs2027432),nlrp5//rs7255920和ciita//(rs12932187,rs1107438,rs8048002,rs6498122,rs4774)。本课题为病例对照研究,分为两个阶段共纳入正常对照1440个,bd患者950个和vkh综合征患者384个。通过taqman和聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism,pcr-rflp)两种方法进行基因分型。本研究运用计数方法统计snp位点各基因型和等位基因的个数,运用卡方检验计算等位基因频率和基因型频率的差异p值,bonferroni校正后记为pc值,校正后的pc值<0.05被认为有统计学差异。基因mrna和下游细胞因子的表达水平分别通过荧光定量聚合酶链反应(real-timepcr,rt-pcr)和酶联免疫吸附实验(enzyme-linkedimmunosorbentassay,elisa)进行测定。结果:bd病的研究分为三个阶段,第一阶段研究发现:在bd患者中位点ciita//rs12932187的c等位基因频率(pc=1.668e-02,or=0.713,95%ci=0.591-0.861)和位点nod1//rs2075818的g等位基因频率(pc=4.694e-02,or=0.698,95%ci=0.562-0.868)均明显低于正常对照组。第二阶段扩大样本数后,得到的结果与第一阶段相符合,在进行数据分析后显示:bd患者中位点ciita//rs12932187的cc基因型频率(pc=3.331e-06,or=0.617,95%ci=0.519-0.735)和c等位基因频率(pc=6.004e-07,or=0.709,95%ci=0.629-0.799)明显低于正常对照组。BD患者中NOD1//rs2075818的GG基因型频率(Pc=1.022E-02,OR=0.536,95%CI=0.386-0.745)和G等位基因频率(Pc=6.811E-05,OR=0.720,95%CI=0.629-0.824)也明显低于正常对照组。第三阶段为功能性研究,结果显示:在给予外周血单个核细胞(Peripheral blood monouclear cell,PBMC)LPS刺激后,CIITA//rs12932187 CC基因型携带者的CIITA mRNA表达被抑制而IL-10的表达水平则明显升高。本实验选择的20个位于NLR基因上的SNP位点与VKH综合征无明显关联。结论:研究表明CIITA//rs12932187和NOD1//rs2075818两个位点均与Behcet病的遗传易感性相关。
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