香菇(Lentinula edodes(Berk.)Pegler)是著名的大型木腐真菌，在我国有已有800多年的栽培历史。香菇子实体的形成是香菇生活史中最复杂的发育过程，需要遗传、环境、生理等因素的协同作用。在香菇子实体发育的起始阶段中，菌丝首先在营养逆境的胁迫下进行局部地聚集而形成扭结体，随后扭结体的密度逐渐增加而形成致密菌丝团，致密菌丝团最终发育为原基，原基本质上是子实体的胚胎结构。本文建立了适合香菇不同发育阶段组织的RNA高效提取方法，与其他常规RNA提取方法相比，该方法的独特之处在于用有机溶剂抽提之前，加入了饱和NaCl溶液，从而促进了多糖物质与蛋白质的去除，并提高了RNA的产量，为下游的分子生物学操作打下了基础。另外，本文运用mRNA差异显示技术比较了香菇菌丝体、菌丝扭结体、致密菌丝团以及原基等四个发育阶段的基因表达差异。四个发育阶段的组织提取RNA后进行反转录，之后用随机引物与锚定引物组合对cDNA样品进行扩增，再用琼脂糖凝胶电泳进行差异条带的展示。结果表明四个发育阶段的基因表达差异不甚明显，最终挑选了17个差异表达的ESTs基因片段进行克隆测序。通过与Gene Bank数据库的比对，发现这些ESTs片段涉及蛋白质的合成、细胞壁的修饰、菌丝间的相互作用、碳氮源的代谢、物质的运输、信号传导、细胞的复苏等过程。其中，一个差异片段被证实为内切多聚半乳糖醛酸酶基因，通过Real-time PCR定量分析，发现该基因在疏松菌丝体、菌丝扭结体和致密菌丝团等三个阶段的表达相对较低，而在原基发育阶段呈现大量的表达，表明该基因可能与香菇原基的形态发生具有密切的关系。