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猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea, PED）是由猪流行性腹泻病毒（Porcineepidemic diarrhea virus, PEDV）引起的一种以腹泻、呕吐和脱水为主要特征的接触性肠道传染病。自2010年冬季以来，由PEDV引起的猪流行性腹泻病在山东省部分地区爆发，引起哺乳仔猪严重的呕吐、腹泻，部分规模化猪场的仔猪死亡率高达100%，给养猪业造成了巨大的经济损失。为了揭示PEDV的流行和遗传变异规律，为预防和控制PED提供更全面的理论依据，本研究进行了以下几方面的工作：1、对2012年1月至2012年4月山东省德州、泰安、烟台、济宁、济南5个地市的15个临床表现腹泻症状的规模化猪场进行了病原检测和流行病学调查，结果显示PEDV的个体阳性率为62.86%（44/70），群体阳性率为100%（15/15）；TGEV的个体阳性率为12.86%（9/70），群体阳性率为20%（3/15），表明造成2012年春天山东省规模化猪场仔猪腹泻的主要病原为PEDV。2、对15株PEDV山东分离株的主要结构蛋白基因M基因进行了序列测定与分析，结果表明15株PEDV的M基因全长均为681nt，相互之间遗传距离较近，处同一分支，与韩国株BIF256、泰国株KU04RB08、KU06RB08、KU07RB08和MNIAH10054208的亲缘关系较近，而与国内2011年分离的SJZ-2011和QY2毒株以及疫苗株CV777的遗传距离较远；对12株PEDV野毒的主要结构蛋白基因N基因进行了全基因序列分析，序列分析表明12株PEDV的N基因全长均为1326nt，相互之间遗传距离较近，核苷酸同源性达99.0%～100%。3、通过细胞培养分离得到一株适应VERO细胞的PEDV毒株SD-M株，并对其进行了全基因序列测定与分析，序列分析结果表明，SD-M株全基因组共包含27953nt，与疫苗株CV777的核苷酸同源性为97.7%，与韩国细胞适应株DR13-的核苷酸同源性为99.9%。基因组结构为5’UTR-ORF1ab-S-ORF3-E-M-N-3’UTR，其中5’UTR为292nt，ORF1ab基因为20321nt，S基因为4149nt，ORF3为276nt，E基因为231nt，M基因和N基因分别为681nt和1326nt。与已发表的PEDV全序列进行比对分析，发现SD-M株的ORF3基因缺少49个碱基，发生了阅读框的移码，导致阅读框架由原来的675nt变为276nt。