【摘 要】
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尽管近年来生命科学及医学不断发展,但依然有很多疾病威胁着人类的生命健康。在全球女性最常见的恶性肿瘤中,宫颈癌（cervical cancer）是第二常见的癌症,虽然目前宫颈癌的筛查工作已经逐步开展,但是在一些发展中国家,宫颈癌的发病率和死亡率仍然处于较高水平。因此,有必要从宫颈癌的基因表达和甲基化的层面深入的理解其对于疾病发生和发展的作用,从而分析其对宫颈癌患者生存的影响。首先,在TCGA数据库中
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尽管近年来生命科学及医学不断发展,但依然有很多疾病威胁着人类的生命健康。在全球女性最常见的恶性肿瘤中,宫颈癌（cervical cancer）是第二常见的癌症,虽然目前宫颈癌的筛查工作已经逐步开展,但是在一些发展中国家,宫颈癌的发病率和死亡率仍然处于较高水平。因此,有必要从宫颈癌的基因表达和甲基化的层面深入的理解其对于疾病发生和发展的作用,从而分析其对宫颈癌患者生存的影响。首先,在TCGA数据库中下载宫颈癌的基因表达、DNA甲基化以及临床数据,并基于宫颈癌的差异表达基因进行单因素COX回归分析,将获得的基因进行GO和KEGG分析,发现有11个差异表达基因与DNA的复制和修复关系紧密。之后利用这11个基因对患者进行Kaplan-Meier生存分析,有6个基因MCM2、MCM5、PCNA、POLA2、RFC5和RNASEH2A的高表达对宫颈癌患者的生存率有潜在的影响。其次,基于宫颈癌的差异表达基因和临床特征进行WGCNA分析时,将患者按年龄进行分组,发现在青年组中,black模块内的基因与血管系统和内皮细胞的增殖与迁移有关系。在中年组中red模块和老年组中turquoise模块内的基因与表皮细胞以及角质化等相关,这表明吸烟对于中年组和老年组的患者有较大的影响。最后,利用差异甲基化基因进行COX和LASSO回归算法构建预后模型,并在此基础上对宫颈癌患者进行Kaplan–Meier分析,发现高风险组的生存率比低风险的生存率要低的多,模型性能评估则采用的是受试者工作特征曲线（ROC）,其曲线下面积（AUC）为0.73,具有一定的预测价值。将患者按年龄进行分组进行Kaplan–Meier和ROC曲线评价,发现模型在中年组中的预测能力一般,在其它年龄段均较为显著。然后将模型中的甲基化基因与其表达数据进行相关性分析,探究了基因的甲基化与表达之间的关联强度,以及其对宫颈癌发生和发展的影响,这些结论或许对宫颈癌的临床诊断有潜在的意义。
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