公立医院作为我国医疗服务体系中的主体,承担着为社会提供便捷、高效、低廉的医疗服务的责任;公立医院具有公益性,即公立医院的运行是不以营利为目的而存在的。正是由于公立医院在整个医疗系统中的重要地位,目前公立医院改革是新医改重点关注并推行的项目之一。而在公立医院改革进程中,医院补偿机制的改革十分必要,同时随着药品零加成政策的推行,财政补偿机制的作用越来越凸显,政府对公立医院的财政补偿方面,到底补多少,怎么补,目前并未有科学的补偿机制,这也是改革的重点难题所在。自新医改以来,中央多次对于财政补偿改革下达指示,其中指出,由于精神类医院、传染类医院、中医类医院、妇产类医院等专科医院具有面向对象的特殊性和运行的公益性,需要在这类医院的补偿政策上予以倾斜,也即本文中的财政差别化补偿。同时,上海市也出台了相关政策,要求探索医疗机构分类管理办法、实行差别化补偿政策,落实相关专科医院的倾斜政策,在运行经费、发展建设支出等方面适当加大补偿力度。因此可见,完善财政差别化补偿机制是新医改的明确要求。本文以上海市公立医院财政差别化补偿的影响因素为研究视角,以政府财政补偿水平为切入点,以上海市24家公立医院的数据为研究依据,探索何种因素会影响到公立医院的财政补偿水平,以期为进一步完善财政补偿机制提出可借鉴意义。在具体研究中,首先从社会需求理论、公共产品理论、公共财政理论和社会比较理论对政府介入公立医院以及实施差别化补偿的必要性进行说明,搭建本文的理论基础。在数据分析中,运用综合指数法对2016年上海市公立医院的相关变量进行指数化处理,以避免量纲不同而产生的影响;在对影响上海市公立医院财政差别化补偿水平的因素分析上,主要采用非参数检验进行相关性分析,探寻影响公立医院财政差别化补偿水平的影响因素。主要研究结论表现为,目前上海市公立医院财政补偿水平,主要和医院的医疗服务数量、运营能力和人员经费比重有关;其中,医院的医疗服务数量和运营能力都和财政补偿水平成反比,人员经费比重和财政补偿水平成正比。最后,再结合专家座谈内容具体分析上海市公立医院财政差别化补偿中存在的问题,以及总结其他国家和地区财政补偿机制的可借鉴之处后,对上海市公立医院财政差别化补偿机制的完善提出可行性建议,在坚持科学管理原则、兼顾供需双方原则、从单独为到合力为原则指导下,多角度分析财政补偿水平的影响因素;调整财政补偿结构,明确补偿内容;明确财政补偿标准,健全补偿方式;多部门联动,让医保发挥重要作用而不是财政兜底。