论文部分内容阅读
植物总是承受着各种环境因子的作用。其中尤以非生物逆境影响最为广泛。Rare-coldinductible(RCI2)基因参与植物非生物逆境耐受。RCI2基因家族普遍存在于生物中,其高度保守,并且编码小分子、高度疏水性蛋白。RCI2基因调控细胞离子代谢,而能影响膜势。本研究以生物信息学方法分析了玉米RCI2基因家族,包括基因进化、表达。同时,与高粱、小米、水稻和雀麦草进行了比较。本研究结果为探讨RCI2基因功能提供了系统性认识。主要研究结果如下: 1.在全基因组水平检索、验证,获得了10个RCI2基因。根据染色体定位情况命名了这些基因。预测了其所编码蛋白质的分子量、等电点。 2.构建了玉米RCI2基因进化树。此外,还构建了禾本科植物RCI2基因进化树。45个RCI2基因被划分为三类。从整体来看,ZmRCI2基因主要定位在染色体两端。ZmRCI2-3,5、ZmRCI2-4,6为片段复制基因。 3.分析了RCI2基因所编码的蛋白。其氨基酸序列高度保守,形成两个跨膜结构域。分析了禾本科植物45个RCI2蛋白基序。Motif1,2普遍存在,代表跨膜结构域。Motif3多位于蛋白羧基端。 4.分析了10个玉米RCI2基因启动子。ZmRCI2基因大多含有三种顺式作用元件,即:ABRE、LTRE和DRE。ZmRCI2-10启动子含有最多ABRE顺式调控元件。 5.dbEST用于RCI2基因表达分析,10个RCI2基因都有EST表达记录。ZmRCI2-1具有表达特异性,主要涉及根、花序。 6.分析了玉米RCI2基因干旱逆境表达模式。在干旱逆境下,玉米RCI2基因表达呈现多样化。ZmRCI2-2,5,10下调后恢复表达。ZmRCI2-4持续下调表达。ZmRCI2-6持续稳定表达。