内生真菌（endophytic fungi）是指其生活史的某一阶段，生活在宿主植物组织内或植物体表，而不会引起植物发病的一类真菌。内生真菌具有丰富的多样性。研究表明，内生菌的分离结果受采样时间、采样部位的影响。近年来，已有鱼腥草内生真菌的研究报道，并分离出了具有抑菌活性的内生真菌，但缺乏更深入的研究。本试验通过研究鱼腥草不同生长时期、不同组织部位内生真菌种群结构与生态分布，探索鱼腥草内生真菌的生物多样性。取得的研究结果如下：1.从不同季节的鱼腥草根、茎、叶、花中分离得到内生真菌3822株，其中从根分离834株、茎1177株、叶1521株，花290株；春季411株、夏季2782株，秋季629株。根据菌落培养特征及5.8S和序列相似性比较和系统发育树分析共鉴定为55个分类单元，归属到真菌界3个亚门7个纲7个目19个属，其中大多数的分类单元属半知菌的无性型。2.在目的分类水平上，以丛梗孢目（Moniliales）为优势菌群，占总菌株数量的61.62%；在科的分类水平上，暗梗孢科（Dematiaceae）占总菌株数量的38.41%；在属的水平上以交链孢属（Alternaria）和镰孢菌属（Fusarium）为优势类群，分别占总菌株数量的37.55%和18.50%。交链孢属（Alternaria）、刺盘孢属（Colletotrichum）、镰孢菌属（Fusarium）、茎点霉属（Phoma）为组织不同部位的共同菌属，交链孢属（Alternaria）、附球菌属（Epicoccum）、镰孢菌属（Fusarium）、青霉属（Penicillium）、茎点霉属（Phoma）和小不整球壳属（Plectosphaerella）为不同季节的共同菌属。3.对不同季节和不同组织部位分离得到的内生真菌进行多样性分析。结果表明：3个季节Shannon-Wiener多样性指数和丰度指数春季最高；而均匀度指数秋季最高。4个组织部位的Shannon-Wiener多样性指数和丰度指数根部最高；而均匀度指数叶部最高。