新的时代,科技的重大作用得到更明确的彰显,它不仅是富国之源,还是最重要的生产力要素。在新时代,科研最密集的领域为高新企业,高新企业的技术发展水平影响着民族的未来、国家的发展,关系着国家所设定的战略目标的实现。对各国而言,税收是非常关键的宏观政策,它早已经超越了财政收入的概念,被选来激励企业在科技方面的创新。近年,中国也不断出台税收政策,希望借助税收激励推进企业在创新层面研发活动的开展。在此背景下,讨论税收激励政策的有效性,对政策部门制定下一步公共政策具有重要的参考意义。本文在以往学者研究的基础上,通过理论分析和实证分析相结合的方法,比较分析了税收激励与政府补助对高新技术企业的科技创新激励效应。本研究先从经济学的视角对政府补助和税收激励在科技创新方面对企业所产生的激励效应进行了分析,同时还构建了分析模型,期望能够借助该模型科学的量化不同工具在科技创新方面所产生的具体影响。在此基础上,本文通过筛选样本、搜集相关的数据、利用STATA进行数据实证分析。本文以2009-2012年74家高新技术企业为研究对象,主要从三个方面进行实证分析:首先,选择研发强度为指标,运用描述性统计分析企业相对应的规模大小;二是提出假设、建立模型、设立变量,比较税收激励与政府补助这两种政策工具的激励效应对R&D支出的影响最大。三是从回归模型比较不同政策工具在研发支出方面所产生的激励效应,得出税收激励相比于政府补助对于高新技术企业具有更大的刺激作用。最后,总结出当前税收激励主要存在的问题,同时按照实证分析的结果给出政策性的具体建议。