真菌广泛分布于陆地、淡水和海洋生态系统中，是一类在生物地球化学循环中发挥重要作用的微生物。然而在对海洋微生物的研究范畴内，对于海洋环境中真菌的生物多样性和生化性能分析是当前的一个热门研究方向。本论文主要从三个方面对深圳近海岸的真菌进行了分析:可培养真菌的分布以及简单的多样性分析;筛选产胞外酶（包括纤维素酶、脂肪酶和漆酶）真菌以及进一步的产酶定量分析;以及真菌形成团块的研究。　　本文首先研究了深圳——中国华南地区近海岸海域中可培养浮游真菌的分布情况，并做了简单的多样性分析。实验采用多培养基法分离深圳近海岸水域中的可培养真菌，并依据通用引物ITS1&ITS4对这些真菌菌株的ITS-rDNA片段基因进行PCR扩增，然后测序、比对鉴定后，在构建的真菌系统发育树基础上对真菌的分布情况进行分析。本实验自30份海水样和2份底泥样中分离鉴定出了31株真菌菌株，其中包括22株丝状真菌和9株酵母菌。显微镜观察和ITS-rDNA基因序列分析表明，这些真菌主要是集中在子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)，仅有3％的真菌分布在结合菌门(Zygomycota)的毛霉亚门(Mucoromycotina)中。　　其次，本文还对这31株菌株的产胞外酶（纤维素酶、脂肪酶和漆酶）的能力以及酶学性能进行了定性和定量的分析。在定性初筛的培养基生长5天后，大多数菌株呈现出2-3种胞外酶活力的溶解圈，而9个酵母菌菌株都没有检出漆酶活力。在定性测量的结果基础上，挑选出产酶潜力大的2株丝状真菌(PKU F16，PKU F18)和2株酵母菌(PKU Y5，PKU Y8)，进行三种胞外酶的定量分析。在各菌株培养4、6和9天时，分别对三种胞外酶活进行测定，结果发现各菌株生产三种胞外酶的定量分析结果与定性分析结果基本吻合，且随着培养时间的增长，菌株的胞外酶活力呈现先增后减的趋势。在第6天，F18和Y8产纤维素酶活力高达1.13和1.31 Umin-1 ml-1。Y8的脂肪酶活力产量高达21.94 Umin-1 ml-1。F18和F16产漆酶活力高达14.61和10.50 Umin-1 ml-1。研究表明，大多数的真菌呈现出可观的多种胞外酶的产酶能力。　　最后，本文还发现在不同PH的液体培养基上，1株毛霉菌(PH=4、6)和1株青霉菌(PH=4、6、8)可以产生大量且直径为4-6mm的团块，此时真菌的孢子接种浓度为107左右。随后的一个真菌团块收获微藻的小试验发现，真菌团块可以用来通过与微藻溶液混合，最高可实现93％的微藻去除率。因此，为利用真菌团块收获微藻或废水处理提供了基础研究。