近几年,随着市场经济的快速发展,云南省内各州市经济发展不平衡度提高,税收收入的总量和结构也在州市间呈现出不平衡的状态。烟草作为云南的支柱产业,对推动云南经济跨越发展具有举足轻重的作用。烟草行业税收是云南省税收的主要来源,由于烟草体制机制不完善和税收体制税收制度缺陷等原因,税收与税源产生背离,税收在各地区之间发生转移,这种区域税收分配失衡状况不利于云南省经济可持续发展,不利于地域间经济的平衡,加剧了云南省各州市之间经济发展的差距。本文利用数学模型,以红塔集团工业烟区域税收分配和云南省楚雄州商业烟区域税收分配作为研究对象,全面测算了该地区烟草行业区域税收分配情况,得出烟草行业税收是由多数经济欠发达地区流向少数经济发达地区、由多个生产地向税收核算地转移、由多个分支机构向总机构转移的且商品税的税收分配不平衡度高于所得税的税收分配不平衡度,烟草行业区域税收分配失衡加剧了地区间经济发展的不平衡,导致税收分配不公平,各地区之间为争夺税源而恶性竞争。本文分析了烟草行业区域税收分配失衡即税收与税源背离的原因是税收制度设计不尽完善、地方有效主体税种缺失、烟草专卖制度造成的税收与税源背离、我国实行以商品税为主体税种的税制结构、税收背离度与税收在GDP中所占比重存在函数关系。本文针对当地的税收具体状况,从加强顶层设计建立协商沟通机制、完善税收制度设计、推进卷烟消费税改革、深化税制结构改革、完善省以下地方政府主体税种、深化税收计划管理体制改革、优化产业结构、改革和完善烟草专卖制度、完善财政转移支付制度、优化纳税服务等几个方面提出了相应对策,目的就是为了实现税收分配的地域平衡,促进区域经济协调发展,从而推动云南省经济的均衡发展。