某些植物雌激素与ER_α及ER_β蛋白相互作用的分子动力学研究

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植物雌激素由于具有副作用小但能够发挥雌激素样和/或抗雌激素作用等优点,近年来对此类化合物的研究有增无减。植物雌激素的类雌激素作用是通过与雌激素受体蛋白的结合来发挥的,因此研究二者之间的相互作用就非常重要。本论文用分子对接和分子动力学模拟方法对不同种类的植物雌激素与雌激素受体之间的结合亲和力及相互作用进行了探究。论文内容如下:1、二苯乙烯类植物雌激素白藜芦醇具有较高的应用价值。采用分子对接和分子动力学模拟的方法分别探究白藜芦醇和17β-雌二醇与两种雌激素受体亚型(即estrogen receptorα,ER_α和estrogen receptorβ,ER_β)之间的相互作用。动力学的轨迹分析结果表明体系在模拟后均达到稳定状态。通过与17β-雌二醇的对比结果显示,白藜芦醇对ER_α和ER_β的结合能力小于17β-雌二醇。结合模式表明氢键及疏水相互作用在受体-配体结合过程中起到稳定作用。结合自由能的计算与分解结果表明范德华能和静电能对复合物的自由能贡献较大。2、染料木素、大豆甙元及刺芒柄花素作为异黄酮类植物雌激素中最典型的三种,三者之间结构相似。将这三种异黄酮类植物雌激素分别与ER_α和ER_β进行分子对接,然后进行分子动力学模拟。分子对接及动力学模拟结果表明:三种异黄酮类植物雌激素及17β-雌二醇的亲和力大小顺序为:17β-雌二醇>染料木素>大豆甙元>刺芒柄花素。且其对ER_β的亲和力高于对ER_α的。结合自由能的计算和分解表明范德华能、静电相互作用和非极性溶剂化能促进受体与配体的结合,极性溶剂化能则起相反的作用。3、香豆雌酚、4-甲氧基香豆雌酚、补骨脂素及异补骨脂素四种香豆素类植物雌激素的结构特殊,采用分子对接和分子动力学模拟的方法对其与ER_α和ER_β之间的结合亲和力及相互作用进行探究。计算结果证明四种香豆素类植物雌激素对ER_α和ER_β的亲和力均弱于17β-雌二醇,且4-甲氧基香豆雌酚和香豆雌酚的亲和力明显高于补骨脂素和异补骨脂素的亲和力。另外,结合模式表明氢键相互作用和疏水相互作用对复合物的稳定性具有重要影响。结合自由能的计算和分解探究了各能量项对总自由能的贡献作用。4、采用分子动力学模拟方法分别对植物木脂素(罗汉松脂酚和开环异落叶松脂酚)与动物木脂素(肠内脂和肠二醇)和ER_α及ER_β的结合亲和力进行了探究。分析结果表明四种木脂素类植物雌激素对ER_β的结合亲和力高于对ER_α的,并且植物木脂素罗汉松脂酚和开环异落叶松脂酚对ER的亲和力高于动物木脂素肠内脂和肠二醇对ER的亲和力。
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