细胞生长相关新基因PP3105的克隆及其初步功能研究

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原发性肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC )是我国高发的恶性肿瘤之一[1],其发病率分别居我国男性和女性常见肿瘤的第三和第四位,全世界每年新发的HCC患者40%在我国。HCC恶性度较高,属于严重危害我国人民群众健康的重大疾病。目前的研究表明,HCC的发生发展和转移过程是一个由多种基因参与、相互作用,并受到多因素调节影响的复杂过程。许多癌基因、抑癌基因以及相关基因的激活或异常失活是肝癌发生的分子基础[2]。因此寻找新的与肝癌相关的基因和抑癌基因,并进一步深入揭示原发性肝细胞肝癌发生和发展的分子机制,可能为肝癌的早期诊断和治疗提供新的思路和途径。为了寻找和分离与HCC相关的基因,本实验室建立了一种高通量的以细胞生长为基础的功能筛选方法。首先构建定向的真核表达的人胎盘cDNA文库,建库时选用大于2kb的片段装入载体,保证cDNA文库中相当一部分是全长基因。通过高通量基因转染技术筛选人胎盘cDNA文库,寻找对肿瘤细胞生长、分化、调节有较明显影响的基因进行功能研究。PP3105 (GenBank No. AF193052)就是通过上述方法获得的一种功能未知的新基因,经测序后将序列与网上GenBank进行Blast比对,确定其全长为3246bp,预测编码蛋白质由460个氨基酸组成。并经计算机电子克隆获取全长cDNA进行研究,获得的两种不同形式全长cDNA:大的转录本全长3246核苷酸,编码460氨基酸,称为PP3105-A,与GenBank No. NM 022154的cDNA序列相同,小的转录本全长2680核苷酸,编码246氨基酸,称为PP3105-B;并且为一新的转录本。用PP3105-A全长cDNA序列通过Blast及e-PCR两种程序分析,结果显示基因PP3105定位于人类染色体4q22-24区域。同时获取相应区段的基因组序列(GenBank No. NT 006383),将PP3105-A、PP3105-B序列与基因组序列比对显示:PP3105-A、PP3105-B均含有8个外显子,其中仅有第一个外显子不同,导致其起始编码子的变化。人类多组织RNA膜片Northern 杂交结果显示PP3105在心、胎盘、肺、肝、肾、胰中有明显表达,而在脑、肌肉中表达不高。在胎盘中有两条杂交带,显示有两种不同转录本,在胎盘组织中显示为大小两种转录本,在胰腺中显示的是小的转录本(PP3105-B),而心、脑、肺、肝、肾组织中为大的转录本(PP3105-A),在肌肉组织中没有表达,生物信息学分析显示:PP3105-A含有3个N-糖基化位点,3个蛋白激酶C磷酸化位点,6个酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点,10个N-肉豆蔻酰化位点,2个氨基化位点及一个亮氨酸拉链结构。SMART程序分析结果显示:PP3105-A是一个膜蛋白,N端120个氨基酸为信号肽序列,含有6个跨膜区,一个锌传导的保守Zip功能域;利用RH(Radiation Hybrid)染色体定位方法把PP3105 定位于染色体4q22-24区域。为了进一步研究PP3103-A对癌细胞生长的影响,我们分别进行了亚细胞定<WP=6>位、集落形成实验及筛选单克隆及绘制生长曲线等实验。亚细胞定位实验显示PP3105-A分布在细胞膜和细胞浆中,与生物信息学分析结果相符;集落形成实验显示PP3105-A对SMMC7721细胞体外集落形成有明显的抑制作用,抑制率为54.5%;生长曲线也表明PP3105-A在SMMC7721细胞的表达可能对细胞的体外增殖有一定的抑制作用。故我们推测PP3105可能是一个新的金属离子尤其是锌的转运蛋白,并且与肝癌细胞的生长、增殖相关。
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