多组学用于卵巢癌发展、凋亡、调控、新分类方式探索及相关靶点及信号通路研究

来源 :中国人民解放军医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:TORO_123
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研究目的:本课题利用采用小分子药物、非编码RNA序列及多组学方法,探索卵巢癌发展的相关调控因素,并根据TCGA数据库的信息,对浆液性卵巢癌进行多组学分析,探索卵巢癌的调控机制、凋亡相关因素其核心目的是找到一种新的诊断和治疗方法,可以优化卵巢癌,这对更多的卵巢癌患者有益。研究方法①使用Arctigenin对上皮卵巢癌细胞系OVCAR3和SKOV3进行抑制实验。用Ac-DEVD-CHO预处理卵巢癌细胞抑制了 caspase-3活性。转染空载体或pcDNA3.1-Survivin的质粒。使用Arctigenin直接干预所研究的细胞并使用稳定而可靠的细胞凋亡检测试剂盒分析细胞凋亡。Western blotting和ECL化学发光检测系统检测免疫反应性复合物的结合;②利用成熟的实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)用于检测卵巢癌组织样本中DARS-AS1的表达的程度。检测DARS-AS1对卵巢癌增殖和转移的影响,通过荧光素酶测定和RNA免疫沉淀(RIP)对潜在机制进行探索;③根据公共数据库的599例浆液性卵巢癌患者的1203个样品的DNA甲基化、蛋白质、microRNA和基因表达情况采用无监督分类算法进行分类,依据RNA-seq数据分成9个亚型,再将亚型与预后以及临床因素之间进行关联评估,并对基于不同组学数据整合的亚型进行关联性评估。研究结果①基础状态时卵巢癌细胞存在iNOS高表达。与对照组相比,Arctigenin治疗组中iNOS的表达水平比基线低2至4倍。与化学NO供体共孵育时,由Arctigenin诱导的STAT3磷酸化和Survivin表达受抑现象被逆转;外源性NO的加入可拮抗牛蒡子素诱导的卵巢癌细胞凋亡。②DARS-AS1在卵巢癌组织中的表达显着高于癌旁组织。当DARS-AS1在卵巢癌细胞中沉默时,细胞增殖受到抑制,细胞迁移和侵袭能力也受到抑制。microRNA-532-3p是DARS-AS1在卵巢癌中的直接靶标。敲除DARS-AS1后,miR-532-3p表达上调。③(1)基于RNA-seq结果将SOC分为九个亚型,相关基因主要在以下四个生物学行为过程中聚集:免疫活性、激素代谢、间充质发育和MAPK信号传导过程中(2)基于DNA甲基化、蛋白质和microRNA表达水平的结果根据甲基化差异分成四种亚型,根据蛋白质阵列分成两个聚类的NMF模型;根据microRNA表达水平发现六组高表达microRNA。(3)基于综合通路确定了四个聚类的PAM模型。结果表明基于一个组学的数据集的亚型无法完全替代其他组学的数据。结论①Arctigenin可抑制卵巢癌细胞增殖。其作用机制是该药物通过STAT3/Survivin信号系统诱导卵巢癌细胞中caspase-3依赖性细胞凋亡;②DARS-AS1通过捕捉卵巢癌miR-532-3p增强细胞增殖和转移;③多组学的研究结果表明:基于一个组学的数据集的亚型无法完全替代其他组学的数据。
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