当前专利技术转移主要包括企业、高校、科研单位以及机关团体等四个主体，其中从数量和频率来看，其由高到低的顺序也基本与上述排列相同。从我国2011年知识产权工作开展情况以及国家“十二五”规划中对于国家创新体系建设的相关阐述中可以看出，我国正在建设以企业创新为主体，高校、科研单位等从事科技创新研究的部门为支撑的科技创新架构。该框架中高校和科研单位由于其主体性质的特殊性，在技术转移、专利运用中存在诸多独特之处。此外，以作为一项动态过程的专利技术转移活动的知识产权保护作为研究内容的更是凤毛麟角，具有很大的研究和完善潜力。本文以此为研究背景，将高校及科研单位归纳为科研事业单位，并对其所共同具有的有别于企业的技术转移知识产权保护问题进行提炼，结合其专利技术转移自身的特点进行阐述。首先，通过对技术转移概念及基本情况的界定，以定量分析为基础，将科学统计数据作为理论研究的依据，结合典型案例和国外发展历程，对其进行深入的提炼和总结。其次，本文通过我国对2010年及其之前的知识产权工作开展情况进行科学调查，以实际数据和工作开展现状为基础，对专利技术转移中权利划分模糊、人员培养和管理制度疏漏、相关机构及配套制度建设的缺失以及专利技术成果评估制度在实践运用中的阻碍等问题进行了分析阐述。最后，本文以此为前提提出了以法律法规的完善、机构设置及其具体管理制度的构建、权利划分和合作制度为主的对策，从多个维度、多个视角对以上问题进行了深入系统的分析，力求构建科研事业单位与企业、国家三位一体的技术转移知识产权保护制度框架。