奶牛场大肠杆菌噬菌体的分离鉴定、生化特性及生物信息学分析

来源 :河南农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:tubage1022
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
抗生素的滥用致使细菌耐药性的产生、药物残留等乳品安全问题尤为突出。噬菌体具有独特的杀菌机制、高度宿主特异性和安全性等优势,有望成为治疗奶牛细菌性乳房炎的一种新的手段。本研究以实验室保存的6株大肠杆菌(K2、Hm4、7140、7525、4525、4818)为宿主菌,与经过预处理的奶牛场污水样混合孵育,离心过滤获得噬菌体原液。首先,采用双层平板法和点滴法对获得的噬菌体原液进行筛选和验证;其次,对噬菌体分离株进行纯化、富集浓缩,透射电镜观察其形态结构特征,通过MOI、一步生长曲线、最适生长温度、最适生长pH、SDS-PAGE蛋白组分、基因组核酸类型等鉴定噬菌体分离株的生化特性;最后,利用高通量测序技术对噬菌体分离株的全基因组进行测序,通过序列组装、评估、功能注释和预测、进化树分析等进行生物信息学分析。结果如下:噬菌体分离株:以大肠杆菌Hm4和7140为宿主菌,成功分离得到2株大肠杆菌噬菌体,分别命名为Hm4噬菌体和7140噬菌体;透射电镜结果:2株噬菌体的头部呈正二十面体,具有可收缩性尾鞘、尾丝,属于肌尾科噬菌体;生化特性结果:2株噬菌体的最佳感染复数均为10-3,最适温度为40~50℃、最适pH为5~10;Hm4噬菌体和7140噬菌体潜伏期分别为10 min、5 min,裂解期分别为60 min、45 min,裂解量分别为 24 PFU/mL、12 PFU/mL;生物信息学分析:2株噬菌体的核酸为ds DNA;Hm4噬菌体基因组全长168,370 bp,GC含量为31.6%,具有10种t RNA和1 1种酶切位点,注释后得到277个CDS,524个ORF;7140噬菌体基因组全长169,642 bp,GC含量为37.58%,具有2种t RNA和1 1种酶切位点,注释后得到270个CDS,704个ORF。2株噬菌体均未发现含有抗性基因与毒力基因。
其他文献
高中物理新课程注重物理知识的形成过程和物理思想方法的渗透,强调探究式教学,注重培养物理实验、科学探究能力.就高中物理的学习来讲,关键在于改变学习方式,培养正确的学习
<正> 《中国流通经济》杂志日前被《中文核心期刊要目总览》(2004年版)编委会确定为中国经济,经济计划与管理类核心期刊。与此同时,也被教育部社政司委托南京大学中国社会科
建立了胶结式内锚头预应力闸墩有限元模型,提出了应用非线性接触力学理论和离散分析方法对胶结式锚固数值进行模拟,并将该方法用于预应力闸墩群锚体系的整体锚固效应的计算中,分
所谓“龙型工业经济”,就是遵循市场经济规律,通过“抓龙头”(培植大型企业集团)、“扶龙身,带龙尾”(辐射、带动中小企业发展),促进区域工业化体系的形成和优化,进而推动区域经济协调
冠菌素是一种新型高效的生物源植物生长调节物质,喷施极低浓度的冠菌素,植物可获得更高的抗逆性和抗病性,具有广泛的应用前景。利用丁香假单胞菌发酵是工业化生产冠菌素有效途径
目的观察左乙拉西坦对老年女性癫痫患者骨代谢、骨密度的影响。方法收入浙江医科大学附属第二医院的老年女性癫痫患者60例使用左乙拉西坦治疗,观察其对骨代谢、骨密度的影响。
短文改错在高考英语中占有举足轻重的地位.全面进行短文改错答题指导显得十分重要。有目的、有计划、有步骤地复习与训练必能更好地提高考生的答题能力。
车辆路径问题(Vehicle Routing Problem,VRP)是组合优化问题领域非常具有挑战性的问题之一,是解决物流配送等实际的路径优化应用中常见的问题。本文研究的是多目标带时间窗的车辆路径问题(Multi-objective Vehicle Routing Problem with Time Window,多目标VRPTW),以车辆数最少和车辆行驶路程最短为目标,求解出一个Pareto最
惩罚性损害赔偿制度是英美法系中广泛认可的一种法律制度.本文在探讨了惩罚性损害赔偿制度的功能与适用范围的基础上,分析了我国<消费者权益保护法>第49条规定的双倍赔偿的构
摘要:本文从说课的指导思想、教材、学情、教法、学法、教学过程等基本内容着手,阐述说课的基本原则和注意事项,来研究有效提高体育教师说课质量和说课艺术的方法。  关键词:说课艺术 说课内容 说课原则 注意事项  一、前言  所谓说课,就是教师在备课之后、上课之前或在上课之后把教材、教法、学法、教学过程等方面的教学思路、设计及依据在短时间内对同行或专家评委作全面讲述的一项教研活动,是教师教学基本功和专业