本文对渤海沉积物反硝化细菌nirS功能基因的多样性进行了研究。为了解渤海反硝化细菌群落的结构与分布情况,以功能基因nirS为分子标记构建渤海沉积物中反硝化细菌的基因文库,再结合渤海沉积物间隙水的环境因子来研究。渤海6个站位总共筛选了524个nirS基因的有效克隆,每个站位根据DNA酶切带型划分的OTUs的种类数也在50～65之间,最相似序列的相似度在71％～100％之间,显示了较高的物种多样性;使用软件DOTUR分析后共得到94个OTUs(AA5％cutoff),利用NCBI数据库中86个最相似的氨基酸序列作为参考序列,用PHYLIP(version3.69)软件包构建系统进化树,包括长江口和东海海域、胶州湾、海河、珠江、养殖水体、太平洋海域、森林土壤湿地、沿海的含水层和沿海沉积物的nirS序列;将其划分为两个大簇,第一簇分为4个亚簇;对渤海各站位进行UniFrac聚类分析,包括Cluster Environments、Jackknife Cluster和PCoA聚类分析,结果表明B01、B05和B07站位聚在一起,再与B03和B11相聚,B15站位与其它站位关系较远;渤海各站位环境因子的聚类分析结果表明反硝化细菌的群落结构和分布是由沉积物间隙水中硝酸盐含量、磷酸盐含量、溶解氧浓度、pH多种环境因子共同作用的结果,影响渤海反硝化细菌的主要环境因子是硝酸盐含量,其次是溶解氧浓度和磷酸盐含量,影响最小的是pH值。