结球甘蓝抗病基因克隆和分离的研究

来源 :西南农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:chengmoshijing
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结球甘蓝是我国的一种重要蔬菜,栽培面积已达几十万公顷,但结球甘蓝病害相当严重,常给广大菜农造成极大经济损失。在我国,有关结球甘蓝的抗病育种研究取得.了很大的进展,已选育出不少抗性材料和抗性较强的品种,在现有的抗病材料中,有些材料往往伴随着经济性状不良而难应用于生产,且用常规的方法难以打破它们的连锁关系。传统的防治病害的方法仅在一定范围内有效,而且都有其局限性,如种子消毒,用化学农药防治既费时费工,又造成环境污染。随着现代生物技术的不断发展,分子生物学研究的不断深入,利用植物基因工程手段来辅助植物抗病育种显示出巨大潜力,把外源抗性基因导入到农作物品种中,增强其对病害的抗性成为可能,从而可以大大加速植物抗病育种进程,开辟了植物抗病基因工程的新时代。建立一个比较完整的cDNA文库,是开展分子生物学研究的基础工作,是分离特定基因,特别是分离高等真核生物基因的有效手段,目的基因的克隆对于研究基因结构,调节机制等方面有十分重要意义。结球甘蓝作为我国一种重要的蔬菜作物,其分子生物学研究方面远滞后于一些大田作物,为了分离结球甘蓝的一些有用基因,本研究构建了结球甘蓝的eDNA文库,并对该文库的部分特性进行了研究。到目前为止,已有一些通过分离克隆植物抗病基因,把抗病基因导入到抗性弱的作物中,以增强其抗性的报道很多,已在玉米,番茄,亚麻,拟南芥,水稻,甜菜,小麦等作物中,成功克隆出许多抗病基因,这些抗病基因表现出对病毒,细菌,真菌或线虫抗性。克隆这些基因主要采用图位克隆法和转座子标签法,这两种方法均需投入大量的人力,物力,耗时,而利用同源序列法分离抗病基因显示出经济,快速的优点,根据抗病基因保守序列设计简并引物,然后用PCR法从抗病材料的基因组或cDNA中扩增出应用于分离抗病基因的探针,对用含抗病基因的材料构建的cDNA文库进行筛选,进而克隆出抗病基因。在本实验中,亦是利用同源序列法,对构建的含抗病基因的cDNA文库进行筛选,分离出一个候选抗病基因,并对其序列以及其编码的氨基酸序列,蛋白质特性和结构预测方面进行了分析研究,同时对该基因亦进行了芥菜的遗传转化的初步探讨。获得了以下结果:1.构建结球甘蓝cDNA文库按SMART cDNA文库构建试剂盒说明进行操作,文库的宿主菌为大肠杆菌XLl—BLue,对文库的部分特性研究结果为:扩增后,文库滴度为4X10~8pfu/ml,插入片段大小均在500bp以上,以1kb的片段占大多数,文库重组体的重祖率为95%,并对该文库进行了扩增,保存。该文库的指标均达到普通文库所需的要求,能够利用该文库进行结球甘蓝目的基因的分离和克隆。2.结球甘蓝抗病基因片段的分离 参照烟草的抗花叶病毒基因N,拟南芥的抗丁香假单抱杆菌基因RPSZ及亚麻的抗叶锈病基因L6的保守区域设计简并引物,其中5’端引物为:5’七 上\3’端引物为:5’-A(A/G)IGCTA(A/G)IGGIA(A/G)ICC-3’。采用 PCR热启动法,分别从高抗TCWi甘蓝材料84075幼苗的CDNA第一条链及基因组中扩增出一条约510hp左右的DNA条带,把PCR产物经纯化回收后,采用T/A克隆法,用T4连接酶连接PUCIU-T载体,转化大肠杆菌DHS。,利用a-互补筛选重组子,进一步通过PCR及酶切验证,表明目的片段己克隆进入质粒载体中。3.抗病基因片段的测定及分析 分别对RT--PCR产物及基因组DNA eR产物克隆成功的重组子进行测序,分析,挑取两个与己克隆的抗病基因同源性比较高的重组子作探针,命名为Borl,BorZ,二者的片段大小为sl3bP,编码171个氨基酸,二者的核昔酸一致性为刀.3兄氨基酸的一致性为61.4儿它们与拟南芥抗丁香假单抱杆菌基因RPSZ同源性最高。4.从叨NA文库筛选目的基因及目的基因序列分析 以Bor,BorZ基因片段为探针,用DIG进行标记,对cDNA文库进行筛选,获得一个阳牲克隆,命名为TURZ,对所得的阳性克隆进行测序和序列分析,结果表明该基因片段大小为762昨,编码226个氨基酸,含有一个68foP的由起始密码子肌G和终止密码子TAA组成的开放阅读框,含有抗病基因保守特征区域雌S的卜环(GGVGM’T)和mR(GLPLAL)区。与基因库的己知抗病基因序列进行比较,结果如下:与甘蓝型油菜的抗病基因同源序列RGA13,结球甘蓝的抗病基因同源序列RGAS,拟南芥的一个类似于N的抗病基因,RPS4基因,一个未命名抗性基因,菜豆的抗病基因同源序列SBS,0B3,大豆的抗病基因同源序列e23,MG63和oh6基因,亚麻的幻基因,L6基因有不同程度的同源性,分别为:7Ch,80%,44%,33%,3gy,33%,51%,肛说,34%,30%,Zthe,29%,与甘蓝型油菜,结球甘蓝的抗病基因片段同源性较高。TuRZ与Borl,BorZ的核昔酸同源性分别达65.2%,76.4%。5.目的基因的Southern杂交和共分离检测 用 TURZ作探针,提取抗病材料84075的DNA,经ede,Ladll,局丑 I,Hholll,SaCI,edi V等酶切后,经电泳,转膜后,进行 Southern杂交和 RFLP分析,结果为:除 edeI酶切,杂交只出现一条杂交带外,其他酶切结果均出现2条以上的杂交?
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