系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞CREBL2,CDKN1B,GPR19基因表达研究

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研究背景系统性红斑狼疮(SLE)是一种典型的较常见的自身免疫性结缔组织病,以多种自身抗体的产生和循环免疫复合物清除障碍为特征,患者临床表现的轻重缓急存在较大的个体差异,预后也不尽相同。目前大多认为其发病与遗传背景、个体生存环境、体内的雌激素水平等相关,其中遗传基础的影响显著。随着人类基因组学、遗传学研究方法的进步,对SLE的相关遗传学发生机制的研究越来越深入。不同地区的多个研究团队对不同人群进行研究,目前已发现超过60个SLE的易感基因或位点。2013年杨万岭等对多个人群的研究结果进行Meta分析发现,染色体12p13.1区域三个位置相邻的SLE易感基因基因CREBL2、CDKN1B、GPR19,且三者之间存在最小的有用连锁不平衡(minimum linkage disequilibrium,LD)。其中CREBL2,CDKN1B,GPR19对应的单个核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)rs12822507,rs10845606,rs34330与SLE之间的相关性均达到基因组水平的意义(3.8 3×10-17≤Pcombined≤2.2 3×10-8)。CREBL2(cAMP responsive element binding protein like 2)有48个碱基片段与CREB基因相同,该片段编码CREB蛋白的b ZIP区域,可与DNA结合,参与调节细胞周期的进程。GPR19(G protein-coupled receptor 19)在人体胚胎干细胞中高表达,编码孤儿受体蛋白,有GPCRs(G protein-coupled receptors)家族的7个跨膜结构域,其与多巴胺D2受体家族、肾上腺素受体、神经肽Y受体之间结构非常相似。CDKN1B(cyclin-dependent kinase inhibitor 1B)编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂,抑制DNA合成前期(G1期)到DNA合成期(S期)的进程,负调控细胞循环,阻碍细胞分化;同时,参与调控T细胞免疫耐受,以及CD4+T和CD8+T之间的动态平衡。既往已发现12p13区域多个基因参与自身免疫性疾病的发生,如NKG2,CD4,C1s/r,CD163,AID等,有关CREBL2,CDKN1B,GPR19与SLE的关联研究尚未深入。本实验利用基因分析的实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative polymerase chain reaction,q PCR),检测CREBL2,CDKN1B,GPR19在SLE患者和健康对照个体中的相对表达量,进一步探索CREBL2,CDKN1B,GPR19与SLE发病的关联及可能的作用机制。目的研究SLE患者和正常对照个体的外周血单个核细胞(PBMCs)中CREBL2,CDKN1B,GPR19基因的相对表达量和组间的表达水平差异,探索基因的表达水平与SNP点rs12822507,rs10845606,rs34330之间的e QTL效应,以及基因表达水平与SLE临床表型、SLEDAI评分之间的相关性。方法收集SLE女性患者119例和女性正常对照129例的外周静脉血样本及临床病历信息,从PBMC中提取出RNA并经逆转录反应获得模板c DNA(complementary DNA),加入荧光染料试剂和基因CREBL2,CDKN1B,GPR19及内参基因GAPDH对应的引物,通过ABI 7500HT测定PBMC中CREBL2,CDKN1B,GPR19的相对表达量;应用ABI 3730XL测序仪对所有研究对象的SNP点rs12822507,rs10845606,rs34330进行基因分型;收集整理基因表达、基因分型结果以及临床资料信息,用SPSS17.0软件做统计学分析。结果SLE病例组中CREBL2和CDKN1B的相对表达量明显低于对照组,且差异具有统计学意义(P<0.001)。未发现SNP点rs12822507,rs34330,rs10845606与基因CREBL2,CDKN1B,GPR19表达量之间存在e QTL作用,差异无统计学意义(P>0.05)。CREBL2在CRP升高,或抗SSA/Ro抗体阳性,或光敏感阴性的SLE患者中表达水平降低,CDKN1B在C3正常或升高,或抗SSA/Ro抗体阳性,或SLEDAI<10的SLE患者中表达水平降低(P<0.05)。未发现基因表达量与SLEDAI之间存在线性相关(P>0.05)。结论CREBL2,CDKN1B与SLE患病存在相关性,且CREBL2,CDKN1B与SLE的临床表型存在相关性,暂未发现SNP rs12822507,rs10845606,rs34330与三个基因表达之间存在e QTL效应。
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