人胃癌肝转移细胞相关基因的筛选

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【目的】研究人类胃癌肝转移细胞的基因表达谱,分析人胃癌肝转移细胞基因表达水平的变化,探讨胃癌肝转移的机制【方法】1、3例手术切除的明确胃癌肝转移病人的胃癌原发组织及胃癌肝转移组织标本,抽提两种组织的总RNA并纯化,经逆转录分别用cy3、cy5荧光标记,获得两组组织cDNA的探针,与SBC人16KcDNA表达谱芯片杂交,通过计算机分析判定差异表达的基因,并对所获得的基因进行生物信息学分析。2、5例手术切除的明确胃癌肝转移病人的原发胃癌组织及胃癌转移组织标本,抽提两种组织的总RNA并纯化,反转录cDNA第一条链,选取差异表达基因的E1A激活基因阻遏子(cellular repressor of E1A-stimulated genes, CREG)及BARD1(BRCA1-associated ring domain protein),设计特异性引物,与上述的cDNA第一链进行RT-PCR扩增验证。【结果】1、基因芯片筛选获得差异表达基因,基因功能涉及11类,包括抗氧化活性相关基因,细胞凋亡相关基因、细胞粘合相关基因、细胞代谢相关基因、细胞周期相关基因等。并进行芯片之间的差异表达基因的比较及聚类分析。2、挑选明显上调的CREG基因和明显下调的BARD1基因,设计特异引物与胃癌原发组织和转移组织RT-PCR扩增,结果显示与基因芯片结果一致。【结论】基因芯片高通量选择出数百条胃癌肝转移的差异表达基因,并选取CREG和BARD1进行反证,为研究胃癌肝转移的基因提供依据与参考。
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