四个树干来源的细菌潜在分类单元的多相分类学研究

来源 :中国林业科学研究院 | 被引量 : 1次 | 上传用户:Sampan_nb
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微生物对森林的各个方面都有重要的影响,本研究开展了梨树溃疡病、杨树细菌性溃疡病、柳树枯萎病病斑组织的细菌区系分析,分离获得4个细菌疑似新分类单元,对这4株细菌进行多相分类研究,确定了其分类地位,为今后这些细菌的开发利用打下基础,研究结果如下:梨树溃疡病的病部组织细菌组成复杂,在病部样品中分离得到了十余种细菌,分属于9个不同的属。杨树细菌性溃疡病的病部组织细菌区系进行分析显示,在病健交接处分离得到了近100株细菌,分属于36个不同的属,共58个细菌物种,在所分离的这些细菌中,以Pseudomonas,Microbacterium,Enterobacter和Bacillus四个属的细菌种类最多。在对柳树枯萎病的病斑组织进行细菌种群分离鉴定时,在病斑组织中分离出了优势种群Brenneria salicis,通过接种实验发现分离自杨树和柳树的Brenneria salicis具有寄主专化性。另外对4种潜在分类单元鉴定研究获得如下结果:(1)Herbaspirillum piri sp.nov描述菌株sh Q-4T在无氧条件下不能正常生长,有运动能力。细胞大小为0.8μm×1.5μm。sh Q-4T的菌落颜色略微发黄,菌落表面光滑不褶皱。经生长环境耐受性实验验证,sh Q-4T在10°C以下和41°C以上不能进行正常的生长发育过程;酸碱性的耐受范围适中(范围约为p H 4.0-8.0);所能忍耐的盐浓度范围为1-3%(w/v)。菌体内脂肪酸含量最高的4种成分是C16:0,C16:1ω6c/C16:1ω7c,cyclo-C17:0和C18:0,呼吸醌成分有Q-7(6%)和Q-8(94%),sh Q-4T的GC含量为60.4mol%。sh Q-4T是Herbaspirillum属的新种,该种的模式菌株为分离自梨树树皮组织的sh Q-4T(=CFCC 14641T=LMG 52804T)。(2)Sinorhodobacter populi sp.nov描述sk2b1T不具有运动性,在无氧环境能正常生长,细胞长1.3μm-1.5μm,宽0.7μm-0.8μm。sk2b1T对温度的耐受范围为10°C到41°C之间;酸碱性的耐受范围适中(范围约为p H5.0-7.0);当环境Na Cl浓度约0-5%(w/v)时,细菌可以正常生长,当环境Nacl浓度大于7%时,该细菌无法正常生长。C16:0(8.8%)和C18:1ω7c/C18:1ω6c(79.43%)在菌体的总脂肪酸含量中占比最高。细菌主要呼吸醌成分为Q-10。该物种的模式菌株为sk2b1T(=CFCC14580T=KCTC 52804T).(3)Ancrocorticia populi sp.nov描述sk1b4T为革兰氏阳性细菌,在厌氧条件下可以正常生长发育,菌体不存在鞭毛结构,细胞为长0.4μm-0.6μm,宽0.3μm-0.4μm的短棒状细菌。sk1b4T的生长温度耐受范围为10℃-41℃,在p H小于6.0或者大于9.0的环境下,细菌均不可生长。细菌对Na Cl浓度的耐受范围为0%-5%,不含有呼吸醌。主要脂肪酸成分为C14:0(41.3%),C16:0(27.2%)和C18:1ω9c(9.9%)。该物种的模式菌株为sk1b4T(=CFCC 14656T=KCTC 39919T)。(4)Brenneria salicis两个亚种描述分离自杨树的Brenneria salicis能够在对环境温度耐受性为10℃-37℃;p H耐受范围5.0-9.0;该细菌所能忍受的盐浓度的范围为0-3%(w/v)。C16:1ω6c/C16:1ω7c(22.52%),C16:0(24.74%)和C18:1ω7c/C18:1ω6c(22.84%)这三种脂肪酸成分在菌株内含量最高。基因组GC含量约为53mol%。故将其分类为Brenneria salicis的新亚种,并命名为Brenneria salicis subsp.populi subsp.nov,模式菌株为CFCC 11710T。分离自柳树的Brenneria salicis细菌在低于10℃和高于37℃的环境条件下均不能正常生长;p H耐受范围6.0-9.0;该细菌所能忍受的盐浓度的范围为0-3%(w/v)。C16:1ω6c/C16:1ω7c(23.13%),C16:0(24.22%)和C18:1ω7c/C18:1ω6c(20.83%)这三种脂肪酸成分在菌株内含量最高,C18:0ante/C18:2ω6,9c(0.63%)是该亚种特有的脂肪酸。基因组GC含量约为53mol%。其为Brenneria salicis subsp.salicis subsp.nov,模式菌株为CFCC14753T=LMG 6144T
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