3株新菌的分类鉴定及新型耐热琼胶酶基因的克隆表达

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a9y3s118x3f
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着人类社会和经济的不断发展,陆地资源已经日益匮乏,为寻找支持人类进一步生存和发展的不竭资源,人们把注意力转向了占地球总面积71 %的海洋,对海洋资源的开发利用已成为各国战略性发展的主旋律。海洋是地球上最大的生物栖息地,其中生活的海洋微生物,种类众多且在特殊环境下形成了独特的代谢方式,成为海洋资源开发与利用的新宠。因此,对海洋微生物的生态、生理、遗传特征和生物活性物质等的研究都具有重大的理论意义和实际价值。本文在前期进行的微生物资源多样性研究的基础上,对几株新发现的新菌进行了分类鉴定并对其中一株新菌产生的琼胶酶进行了研究。本文对分离自青岛近海的一株革兰氏阴性、严格需氧的琼脂降解菌YM01T进行了分类学鉴定。结果表明,该菌细胞呈杆状,具有周生鞭毛,细胞首尾相连形成长链。YM01T生长需要Na+,不需要海水。能够水解羧甲基纤维素、淀粉、七叶灵和吐温80,不能水解卵磷脂、明胶、尿素以及酪蛋白。甲基萘醌-7(MK-7)为该菌主要的呼吸醌。其主要的脂肪酸组分为C16 : 0(38.3 %), C16 : 1ω7c和/或iso-C15 : 0 2-OH(29.0 %), C18 : 1ω7c(9.3 %)和C10 : 0 3-OH(8.2 %)。主要的极性脂为磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰甘油(PG)和氨基磷酸酯(PN)。该菌DNA的G+C含量为44.8 %。YM0T与所有已经报道的细菌16S rDNA序列相似性都低于91 %,构建的系统进化树显示,YM01T属γ-变形菌纲的交替单胞菌科,并形成了一个单独的分支类群。根据该菌在表型特征、化学分类特征和系统发生分析上所表现出来的特殊性,认定该菌为γ-变形菌纲中的一个新属新种,命名为嗜琼胶卵链菌(Catenovulum agarivorans gen. nov. sp. nov.)。从中国南极中山站沿岸潮间带中分离到一株耐低温(0-30℃)、中度喜盐(7-8 % w/v, NaCl)的专性异养细菌,实验室编号为ZS2-28T。基于16S rDNA的系统发生分析表明,ZS2-28T属于α-变形菌纲Roseibaca, Roseinatronobacter和Rhodobaca属细菌分类群中一个单独的进化支,与其他已知种属细菌的相似度均低于97 %,为一株潜在的海洋新菌。该菌能够产生菌绿素-a,胞内含有聚β-羟基丁酸脂颗粒,胞外附着有分泌物。主要的细胞壁脂肪酸组分为C18 : 1ω7c。主要的呼吸醌为泛醌10。主要的极性脂包括磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰胆碱和一种无法鉴定的氨基脂。基因组DNA G+C含量为63.3 mol%。根据表型、化学分类特征以及系统发生分析的结果,确定ZS2-28T代表了一个新属新种。命名为南极红柠檬菌(Roseicitreum antarcticum gen. nov. sp. nov)。此外,从人类唾液样品中分离出一株产可溶性棕色色素的细菌,实验室编号为MY15T。基于16S rDNA序列的系统发生分析表明,该菌株与海洋类香味菌(Myroides marinus JS-08T)、M. odoratimimus LMG 4092T和深海类香味菌(M. profundi D25T)亲缘关系最近,序列相似性分别为96.5 %, 96.3 %和96.1 %。该菌革兰氏染色呈阴性,细胞杆状,不具有鞭毛,不能运动。不能产生Flexirubin类色素。MY15T以甲基萘醌-6为主要的呼吸醌,C15:0 iso (51.2%), C17:0 iso 3-OH (12.9%)和C13:0 iso (10.5%)为主要的细胞壁脂肪酸。DNA G+C含量为34.3 mol%。根据该菌在遗传进化与表型特征上与类香味菌属其他细菌所表现出来的差异性,认定MY15T为类香味菌属的一个新种,命名为棕色类香味菌(Myroides phaeus gen. nov. sp. nov)。本文在对嗜琼胶卵链菌YM01T分类学研究的基础上,对其琼胶水解酶进行了进一步研究,发现YM01T能够产生耐高温、耐蛋白酶K的琼胶酶,在100℃和90℃分别孵育120 min和240 min后仍能保持33.3 %和44.4 %的活性。此外,利用简并PCR和hiTail-PCR法克隆了一个琼胶酶基因。该基因编码781个氨基酸,理论分子量为89 kDa, SingalP分析其N-端51个氨基酸为信号肽序列,结构域分析表明该酶属于糖苷水解酶42家族。
其他文献
在昆明召开的世界园艺博览会结束后,由几家公司共同组成世博园股份有限公司,实现了由政府行为向企业行为的转变,走上了企业市场化运作的道路.如何使世博集团发展壮大,关键在
棉花购销过程中的质量检验并不是一项孤立的单纯的技术工作,而是一个多层次、多方位、变化大并且与商品棉经营过程中的全面质量管理体系密切相关的有机整体。实践表明,在企业
美国科学家公布的最新研究说,他们已经培育出能够在极端干旱条件下存活并生长的转基因植物。科学家希望,面对全球干旱土地面积不断扩张的趋势,这一成果在未来可能有助于减少因干
丝绸之路经济带和中巴经济走廊建设战略的推动,促进了中国企业到国外投资。近年来,多家中国企业参与巴基斯坦的基础设施建设。从未来的发展趋势看,中国企业在巴基斯坦投资空
目的:利用MassARRAY质谱测序方法在中国汉族人群中分析散发性帕金森病(SPD)相关易感基因的多态性,为早期识别易感者及进一步探讨发病机制与治疗的研究提供依据。方法:收集南
电力工程作为国民经济的重要组成部分,其根本任务就是保证电力系统安全、可靠、经济的运行,这就从本质上对电力工程的设计工作提出了非常高的要求。而技术经济作为电力工程设计
菊花作为一种“药食同源”的物品,有着庞大的消费群体。然而,目前国内外尚未有同时满足多种菊花样品中多农药残留的检测方法,同时国内针对菊花的农药登记数量少,最高限量标准缺失。因此构建多种菊花样品中高效、快速的多农药残留分析技术对我们开展合理有效的相关技术研究和农药监控具有重要意义。本研究基于菊花本身含有丰富活性物质的特点,利用新型碳纳米材料—氨基化多壁碳纳米管(MWCNTs-NH_2)作为分散固相萃取
随着我国建经济的不断飞跃式发展,大量的木材应用在各行各业中,占据着重要的地位。但是由于木材性质的不同,造成了它们的用途以及加工工艺的不同,因此我们应该分别得对其结构以及
光伏出力具有间歇性、随机性等特点,规模化接入会影响配电网的安全运行。储能系统能够有效地弥补光伏电源波动性的缺点,直接接入高光伏渗透率的配网系统或与光伏组成光储微网