南方水稻黑条矮缩病毒S9-1被预测能编码病毒基质蛋白。病毒基质蛋白是病毒复制增殖的关键。因此我们研究抗病毒病活性小分子与SRBSDV P9-1的相互作用及结合方式,可以为新型高效的抗病毒药物的研制打下一定基础。本研究以原核表达方式获取南方水稻黑条矮缩病毒(South rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)P9-1为靶标蛋白,通过微量热泳动法、等温滴定量热法技术对33个抗病毒活性小分子进行初筛,针对作用MST、ITC结果差异较大的化合物进行成盐,并采用计算机分子对接计算出抗病毒活性小分子与SRBSDV P9-1的结合位点,通过定点突变PCR法对野生型SRBSDV P9-1质粒进行突变,利用原核表达获取突变型的SRBSDV P9-1,最终通过微量热泳动法、等温滴定量热法来验证药物与蛋白的结合力。实验结果表明:利用定点突变PCR法成功获得突变质粒,通过三种方法的研究结果表明,将P9-1的精氨酸7、精氨酸110、精氨酸327位突变后,其与小分子X2、X7的结合力弱于野生型与X2、X7的结合力,实验所得结果与计算机模拟结果一致,说明SRBSDV P9-1的7、110、327位精氨酸是X2、X7的关键结合位点;并通过农杆菌介导法验证X2在活体上的作用。