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伴随着杂种优势利用技术以及现代育种研究的发展，我国玉米种质基础狭窄和利用效率低的问题突出（李明顺，2005）。Tuxpeno种质遗传基础广泛，遗传变异丰富，了解Tuxpeno种质的杂种优势和配合力，有利于最大限度地利用它们进行育种研究。配合力高的材料可作为有利等位基因资源引人温带育种方案，拓宽种质基础，进一步提高产量和抗性；因此，开展外来种质与适应种质间的杂种优势和配合力分析，是玉米种质研究中必不可少的重要内容。 本研究采用NCⅡ遗传交配设计，利用贵州省旱粮研究所提供的5份玉米Tuxpeno种质材料与我国五大玉米类群的测验种组配25个组合，田间试验设计采用完全随机区组，共调查15个农艺和产量性状。收集整理数据，进行方差分析和配合力分析（包括各性状的一般配合力（GCA）和特殊配合力（SCA）效应分析）。同时，采用SSR分子标记技术，选用25对引物对Tuxpeno种质进行遗传多样性分析。主要研究结果如下： 1、通过15个农艺和产量性状配合力效应分析；在Tuxpeno种质的一般配合力（GCA）效应中，大19在穗位高、秃尖长、穗行数、单株籽粒产量和叶片数性状的一般配合力（GCA）相对效应值较高；449在抽雄、散粉和吐丝期性状的一般配合力（GCA）相对效应值较高；81565在株高、穗位高、出籽率和小区产量性状的一般配合力（GCA）相对效应值较高；405在行粒数的一般配合力（GCA）相对效应值较高；94-90在穗粗和百粒重性状的一般配合力（GCA）相对效应值较高；因此，该材料在其性状的一般配合力（GCA）效应值高，说明该材料受加性基因效应比非加性基因效应强。通过两点联合小区产量的一般配合力（GCA）和特殊配合力（SCA）效应分析，在5个Tuxpeno种质选系中，81565的两点联合小区产量一般配合力（GCA）相对效应值最高，其值为2.47；405的两点联合小区产量一般配合力（GCA）相对效应值最低，其值为-2.82。25个组合中，94-90×MO17（s=6.86）的两点联合小区产量特殊配合力（SCA）相对效应值最高。 2、根据两点联合小区产量和（贵阳）小区产量综合分析；在25个组合中，81565×78599，大19×掖478和81565×掖478为强优势组合。81565、大19和掖478个自交系的GCA效应值相对较高，参与形成的强优势组合多；由此，预测这三个自交系在贵州省玉米育种和生产上有较大的利用潜力。 3、通过产量和构成产量性状的遗传相关系数和通径分析（贵阳）；结果表明，穗行数、行粒数、百粒重和出籽率分别与产量性状的遗传相关系数均达到极显著水平，其遗传相关系数（R）分别为0.2302、0.4041、-0.335和0.43。然而，百粒重和行粒数对产量的直接作用较大，其对产量的直接通径系数（P）分别为0.5592和0.9801；那么，在选育玉米自交系和杂交种时，要优先考虑这二者，同时并兼顾其他农艺性状是玉米高产的有效途径。 4、利用SSR分子标记技术，取均匀分布于各条染色体的55对SSR引物在10份玉米自交系样品进行PCR扩增分析，筛选出25对扩增带型稳定的SSR引物，从供试材料中检测出127个等位基因变异,每对引物检测出2～10个等位基因，平均5.08个。每个位点的多态性信息量（PIC）变化范围为0.20～0.90，平均多态性信息量（PIC）为0.58。UPGMA方法聚类分析表明，10份供试材料间遗传距离变幅为0.4157～0.9722，平均值为0.6907。以遗传距离0.70为阈值，将10份供试材料聚类划分成两大类。 5、通过数量遗传学方法和SSR标记遗传距离聚类分析；结果表明，5份Tuxpeno种质选系小区产量遗传距离聚类（贵阳）和SSR聚类分析结果基本一致。5份Tuxpeno种质选系与测验种中的丹340、MO17和78599的遗传距离三种聚类结果基本一致；但是，5份Tuxpeno材料与掖478和黄早四的遗传距离变化相对差异较大。因此，SSR聚类与小区产量的两种聚类结果差异比较大，需要今后在育种实践工作中去探索和研究。进一步说明，不能简单地用分子标记遗传距离来预测产量；要对产量进行预测，忽视双亲一般配合力（GCA）的作用，这是造成特殊配合力（SCA)与杂交种产量相关程度不高的一个重要原因。 6、结合前人育种实践与本研究的结果分析，将玉米杂种优势模式归纳为：Tuxpeno种质×Lancaster群和Tuxpeno种质×PB群；后者值得在今后的育种实践工作中研究和探索，为我国南方玉米育种杂种优势模式提供一种新的可供选择的途径。