拟南芥组蛋白变异体H2A.Z参与DNA去甲基化的研究

来源 :中国科学院大学 中国科学院上海生命科学研究院逆境生物学研究中心 中国科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dasmine
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以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,研究了组蛋白变异体介导的DNA去甲基化的调控机制,对组蛋白修饰,基因沉默和DNA甲基化进行了深入的研究,为今后研究表观遗传调控下的逆境基因响应的研究打下基础。所得主要结果如下:  1.利用35s启动子甲基化的水平控制SUC2基因表达进而控制拟南芥根的长短,图位克隆到拟南芥抗基因沉默因子-ARP4,ARP6和PIE1。  以模式作物拟南芥为材料,通过35S启动子驱动SUC2基因表达,导致拟南芥的根会在含有蔗糖的培养基上变短,通过EMS诱变,筛选根长变长的突变体,进行图位克隆,并且找到到3个与拟南芥中抗基因沉默相关的作用因子。ARP4,ARP6和PIE1相对应的突变体里,ROS1和IDM1的表达没有受到影响,说明可能是之前没有报道的激活DNA去甲基化的调节因子。  2.在抗基因沉默因子-ARP4,ARP6和PIE1介导的去甲基化过程中的重要作用  通过全基因组甲基化测序,突变体arp4,arp6-1和pie1-1里甲基化水平升高,说明这些基因参与了去甲基化的调控通过蛋白免疫过沉淀技术,研究了ARP4,ARP6和PIE1这3个基因与组蛋白H2A的变异体H2A.Z的相互关系,结果表明拟南芥ARP4,ARP6,PIE1和H2A.Z蛋白是在一个大的复合体里面执行功能。通过染色质免疫共沉淀技术,研究证明了这个复合体所调控的组蛋白变异体H2A.Z在DNA上的富集与抗基因沉默之间的关联,在arp4,arp6和pie1突变体里,在35s启动子这位点,H2A.Z的聚集量减少,甲基化升高。后续实验中,通过CHIP全基因组测序数据,将分析全基因组范围内H2A.Z的聚集与DNA甲基化的相关性。
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