论文部分内容阅读
本研究检测了七世代边鸡群体以及MSTN、MyoD家族部分基因(包括MyoD、MyoG和Myf5基因1和Smad3基因的多态性,并与七世代边鸡的生长性状进行相关性分析;同时利用本课题组前期发现的MSTN基因G2283A位点效应建立的八世代快慢型群体中对MSTN基因、MyoD家族部分基因以及Smad3基因进行多位点和多基因的聚合分析,探讨不同基因型组合之间的合并基因型对生长和屠体性状的效应大小。采用实时荧光定量PCR法研究5个基因在边鸡胸肌和腿肌中的表达关系。主要研究结果如下:1.利用PCR-RFLP技术发现MSTN基因G2283A位点在七世代边鸡中表现为中度多态,相关分析表明,该位点对七世代和八世代边鸡的生长和屠体性状以及肌纤维特性具有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01)。2.以鸡MyoD基因为候选基因,在边鸡群体内检测到4个SNPs,其中外显子中1处T576C的突变,没有引起氨基酸的变化,为同义突变。内含子中3处,分别为G605A、C1837T和G1846A。七世代和八世代群体中,MD-3和MD-4位点均为低度多态,且偏离了哈代温伯格平衡(P<0.05)。相关性分析表明, MyoD基因MD-3和MD-4位点对七世代边鸡生长性状有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01)。MD-3和MD-4位点不同基因型组合中AA/DD和AA/CC为优势基因型。八世代快慢型群体内,MD-3对生长和屠体性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01);MD-4位点对生长性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01)。快慢型群体间,MyoD基因MD-3和MD-4位点与MSTN基因G2283A位点的基因型组合对生长和屠体性状的效应要大于单个MD-3和MD-4位点的效应,主要表现为品系效应。3.以鸡MyoG基因为候选基因,在边鸡群体内检测到2个SNPs,分别为第3外显子T2827C突变和G2957A突变,两处突变均没有引起氨基酸的变化,为同义突变。七世代和八世代群体中,MG-5位点均为高度多态,且处于了哈代温伯格平衡(P>0.05)。相关性分析表明,MyoG基因MG-5位点对七世代边鸡6-10周龄体重有显著影响(P<0.05)。八世代快慢型群体内,MG-5位点对生长和屠体性状没有显著影响(P>0.05)。快慢型群体间,MyoG基因MG-5位点与MSTN基因G2283A位点的基因型组合对生长和屠体性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01),主要还是表现为品系效应。4.以鸡Myf5基因为候选基因,在边鸡群体内检测到3个SNPs,分别为第1外显子中的C238T、G264A和A532G突变,均没有引起氨基酸的变化,为同义突变。七世代和八世代群体中,MY5-1位点分别为高度和中度多态,MY5-3位点均为中度多态,且两位点均处于哈代温伯格平衡(P<0.05)。相关性分析表明,Myf5基因MY5-1和MY5-3位点对七世代边鸡生长性状有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01)。不同基因型组合中HH/NN和HJ/NN为优势基因型。八世代快慢型群体内,MY5-1和MY5-3位点对生长和屠体性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01); MY5-3位点对生长性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01)。快慢型群体间,Myf5基因MY5-1和MY5-3位点与MSTN基因G2283A位点的基因型组合对生长和屠体性状的效应要大于Myf5基因单个多态位点的效应。5.以鸡Smad3基因为候选基因,在边鸡群体内检测到1个SNPs,位于第8外显子A57099T的突变,该位点没有引起氨基酸的变化,为同义突变。七世代和八世代群体中,S8位点均为中度多态,均处于了哈代温伯格平衡(P>0.05)。相关性分析表明,Smad3基因S8位点对七世代边鸡生长性状没有显著影响(P>0.05)。八世代快慢型群体内,S8位点对屠体性状有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01)。快慢型群体间,Smad3基因S8位点与MSTN基因G2283A位点的基因型组合对生长和屠体性状有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01)。6. MSTN基因、MyoD家族部分基因和Smad3基因的表达调控分析结果表明:MSTN基因在野生型(MM)个体的胸肌和腿肌中的表达量显著和极显著高于其在突变型(KK)个体相同肌肉组织中的的表达量(P<0.05和P<0.01)。MyoD基因在腿肌中的表达量与MSTN基因的表达量呈正相关;MyoD基因在胸肌中的表达量与MSTN基因的表达量呈负相关。MyoD基因MD-3位点和MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对MyoD基因表达量有显著影响(P<0.05)。MyoD基因MD-4位点和MSTN基因G2283A位点不同基因型组合个体胸肌和腿肌中的MyoD基因表达量差异均不显著(P>0.05)。MyoG基因的表达量与MSTN基因的表达量呈负相关。MyoG基因MG-5位点和MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对MyoG基因表达量有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01)。Myf5基因的表达量与MSTN基因的表达量呈负相关。Myf5基因MY5-1和MY5-3位点不同基因型对胸肌和腿肌中的Myf5基因表达量有显著或极显著影响(P<0.05)。Smad3基因的表达量与MSTN基因的表达量呈正相关。Smad3基因S8位点和MSTN基因G2283A位点不同基因型组合对Smad3基因表达量有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01)。