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背景和目的:胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumors,GISTs)是胃肠道最常见的间叶源性肿瘤,具有不确定的恶性潜能,容易复发转移。目前研究认为启动子区超甲基化可能是肿瘤抑癌基因沉默的常见机制,并且能够作为肿瘤诊断及预后的标记。本研究通过检测CD117阳性GISTs中E-cadherin(CDHI)、p16基因启动子区CpG岛超甲基化状况和蛋白表达情况分析它们的作用、意义。方法:收集2003-2006年56例GISTs手术切除标本,其中20例同时留取新鲜组织,经常规HE,CD117、CD34、SMA、S-100免疫组化染色确定诊断;采用甲基化特异性PCR(MSP)检测GISTs石蜡包埋组织中E-cadherin和p16基因启动子区超甲基化状态;免疫组织化学方法检测E-cadherin(E-cd)、p16蛋白的表达;并且应用Western-blot方法检测20例新鲜GISTs组织中E-cd和Dysadherin蛋白表达情况。应用SPSS11.5软件进行统计学分析。结果:1.56例胃肠道间质瘤中E-cadherin基因超甲基化率为32%(18/56),在极低、低、中、高度侵袭危险组中分别为9%(1/11)、21%(4/19)、41.6%(5/12)、57%(8/14);p16基因启动子区超甲基化率34%(19/56),在极低、低、中、高侵袭危险组中分别为O%(0/11)、16%(3/19)、50%(6/12)、71%(10/14)。统计分析表明,56例病例中E-cadherin和/或p16基因启动子区超甲基化状态(23/56,41%)与GISTs侵袭危险性分级及部位的差异具有显著性(P<0.05)。2.E-cadherin和/或D16基因超甲基化状态与患者年龄、性别以及组织学类型的差异无显著性(P>0.05)。3.p16基因启动子区超甲基化率34%(19/56),免疫组化分析结果显示,p16蛋白阳性细胞数小于50%病例占44.6%,蛋白表达强度与GISTs侵袭危险性分级之间的差异具有显著性(P<0.05),p16基因CpG岛超甲基化与蛋白表达相关,是GISTs发展的重要事件。4.p16表达强度与GISTs组织学类型、部位、年龄、性别的差异无显著性(P>0.05)。5.Dysadherin在不同侵袭危险度级别GISTs中均有较高水平的表达,其表达量与GISTs危险度相关(P<0.05)。GISTs中仅有E-cd的微弱表达。结论:1.E-cadherin和/或p16基因启动子区超甲基化状态与胃肠道间质瘤侵袭危险度分级显著相关,联合检测可能成为GISTs危险度评估的分子标记物,并将对该病的治疗提供新的思路。2.p16蛋白表达下调与GISTs危险程度有关(P<0.05),表达量小于50%可作为揭示该肿瘤预后不良的指标。p16启动子区超甲基化是蛋白表达下调的原因之一,免疫组化方法检测其表达将成为揭示GISTs预后的可行方法。3.GISTs中E-cd表达微量,可能是GISTs容易发生复发转移的重要原因。Dysadherin蛋白表达与肿瘤危险程度相关,可能为GISTs中E-cd表达减少的机制之一,并有望成为揭示GISTs预后的分子标记物。