馬國翰素有“清代輯伕第一人”的稱號，著有《玉函山房輯佚書》576種66l卷。這是馬國翰最為突出的學術成就，也是研究馬國翰之學者的研究重點。而他於輯伕之外，亦有大量詩文集和其他學術著作。只有全面研讀馬國翰的所有著作，才能對他的學術成就有更為全面的認識，這對於評價馬國翰的學術貢獻及評定他的學術地位是至關重要的。過去，學者能夠見到的馬國翰著作數量有限，所以拓展研究相對困難。《山東文献集成》的出版，改變了這一現狀。其從第一輯至第四輯，集中影印出版了馬國翰的各種著作及與其相關的著作20餘種，大大豐富了研究馬國翰所需的各種文獻資料。所以，全面研究馬國翰的各項條件已經成熟，故應當及時將馬國翰研究向更廣、更深處推進。前人研究馬國翰，已經形成了較為豐富的成果，研究重點基本都在馬國翰藏書和《玉函山房輯佚書》兩個方面。關於馬國翰藏書的研究，多涉及馬國翰的藏書始末、《玉函山房藏書簿錄》所錄書籍的版本、種類及解題特色等方面。對《玉函山房輯伕書》的研究，多涉及《輯佚書》的作者問題、刊刻始末及馬國翰的輯伕過程等方面。這些研究成果為後人研究馬國翰提供了有益的參考和幫助，但是，研究對象相對集中也使得研究寬度稍顯不足，故本文在研讀馬國翰著作的基礎上，擬從六個方面入手，對馬國翰進行較為全面的研究，在前人的基礎上將對馬國翰的研究進行拓寬。首先是馬國翰行年考。論文在王重民先生所整理的馬國翰年譜的基礎上，從更多的原始資料入手，作了更為詳細的馬國翰行年錄。其次是馬國翰著作考。除列出馬國翰著作目錄外，更蒐集到一些不見於馬國翰詩文集中的詩文評語和書序。而從馬國翰的著述來看，他的學術成就是多方面的，說明他是一位十分全面的學者。第三是馬國翰交游考。論文梳理了馬國翰不同時期所交往的友人。馬國翰所交之人，多儒生、文人、學者，體現了中國古代士大夫的交友觀，即注重精神交流和心靈共鳴。第四是馬國翰藏書考。前人在馬國翰藏書方面的研究較為充分，而本文注意到馬國翰所藏清人著作尤多，從《玉函山房藏書簿錄》所著錄的清人著作，可窺清代學術、書籍出版及詩文創作等多方面的狀況，所以，《玉函山房藏書簿錄》的時代意義不容忽視。第五是《玉函山房輯佚書》研究。論文考述了清代輯佚學發展與興盛的原因與《玉函山房輯伕書》的成書背景。對於馬國翰竊章宗源成果的說法進行了辯誣，總結了馬國翰的輯佚原則與輯佚方法，對《玉函山房輯佚書》引書進行了梳理，亦對《玉函山房輯佚書》之敘錄進行了考察。《玉函山房輯伕書》各篇之敘錄，形成一部龐大的伕書目錄，與《玉函山房藏書簿錄》一樣，體現了馬國翰的目錄學成就。而同時著有存書、伕書兩類目錄的學者，除馬國翰外別無二人，從這一點上來說，馬國翰的目錄學成就對於清代目錄學的意義是非同凡響的。第六是馬國翰文學研究。前人在對此涉及較少。論文通過詳讀馬國翰著詩文集、筆記小說和詩文評著作，對馬國翰的文學活動和文學成就進行了梳理和總結。馬國翰一生勤勉，專精輯伕學，同時，他也是一位藏書家、目錄學家和詩人，其在諸多領域皆有建樹，是一位學術身份多元的文獻大家。