论文部分内容阅读
森林土壤中含有丰富的微生物类群,维持着整个生态系统的平衡。但是到目前为止,依然仅有很少的一部分土壤细菌被培养出来。本实验中我们采用了四种培养基,其中两种为常用的分离土壤细菌的DNG培养基与VA培养基,另外两种则是针对森林土壤腐殖质层是主要微生物能量来源的特点,设计的’V2M和V3M两种新的培养基,通过加入微量金属离子、小分子有机酸和少量糖,尽可能模拟土壤最原始环境,同时考虑到土壤中相当部分微生物是寡营养细菌,因此,在培养基设计上,各类成分含量均很低。
采用在VL55的基础上设计了V2M和V3M两种新的培养基培养分离细菌时,可以获得更多菌落,延长培养时间时,新设计的培养基获得更多菌落的优势更加明显。利用四种培养基从森林土壤样品中共分离纯化菌株78株,其中可能的新菌种(16S rRNA基因与GenBank中序列比对系列相似性小于97％)17株,V3M培养基获得的新菌种最多,共8株。与其他三种培养基相比较,V3M培养基分离的菌株种群具有最高的香浓威娜指数(shannon),高的辛普森倒数(1/D)以及稍低的巢氏(Chao1)物种丰富度指数。在比较各培养分离菌株及文库种群结构时,可以看出V3M组与文库组种群结构相似性较高,说明这一培养基在分离培养过程中的倾向性较小,能够有效分离α-Proteobacteria中以前未被培养出来的菌株；而V2M培养基则能够有效分离出Actinobacteria类群的未被培养的菌株。
森林土壤样品中细菌多样性丰富,共检测到9个门级分类单元的细菌,文库中Actinobacteria含量非常少,分离菌株中比率却比较大,因此,在研究土壤微生物多样性时,在条件允许的情况下,应该利用依赖于培养与不依赖于培养的相结合的方法进行研究。
通过多相分类的方法对森林土壤中分离的七株细菌的分类学地位进行研究,结果表明,这七个菌株应为新种,分别命名为Agrococcus terreus sp.nov.(DNG5T),Adhaeribacter terreus sp.nov.(DNG6T),Nocardioides terrae sp.nov.(VA15T),Frateuria terrea sp.nov.(VA24T),Phycicoccus cremeus sp.nov.(V2M29T),Sphingomonas changbaiensis sp.nov.(V2M44T),Micrococcus terreus sp.nov.(V3M1T).