柑橘贮藏过程中汁胞粒化相关miRNA的筛选及功能分析

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bvhd5467h
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
汁胞粒化现象是影响柑橘采后贮藏品质的关键问题之一,几乎在所有柑橘类水果中都有发生,是柑橘产业发展中亟待解决的瓶颈问题。前人研究已发现多种与柑橘采后汁胞粒化产生相关的影响因素,但其分子水平的调控机制尚不清楚。本研究以易发生汁胞粒化的甜橙(Citrus sinensis Osbeck)为研究对象,采用生物信息学分析与分子生物学验证相结合的方法,获得与甜橙汁胞粒化相关的miRNA,并通过miRNA的靶基因功能注释结合采后贮藏实验结果来对所得到的miRNA在采后汁胞粒化过程中的功能进行分析,从转录后水平揭示甜橙贮藏过程中汁胞粒化的分子调控机制,为柑橘类水果采后汁胞粒化的进一步研究与调控奠定理论基础。本文主要研究结果如下:1.基于生物信息学分析法筛选得到柑橘中12个未报道的候选miRNAs。合并已报道的75个柑橘miRNA,对87个miRNAs进行靶基因的预测及功能分析,共得到279个非重复的候选靶基因,其中187个靶基因有其功能注释。2.通过将木质化、营养胁迫及生长发育等与汁胞粒化相关的生理过程与靶基因的功能注释进行比对分析,最终预测获得与汁胞粒化相关的8个miRNAs家族共11个miRNAs可能通过不同的信号通路参与了柑橘的汁胞粒化过程。3.通过将低场核磁测试结果与汁胞粒化程度的感官分级等指标相对应,对柑橘粒化程度进行评级。结果表明:基于低场核磁建立的汁胞粒化评级模型与感官平均分两组结果间没有显著差异(P=0.4982<t=0.7143)。研究结果可应用于柑橘汁胞粒化程度的人工智能鉴定和识别,建立基于人工智能的感官评价分级理化替代技术。4.运用实时荧光定量PCR技术及相关性分析验证得到N-miR159a3p,csi-miR397,N-miR828,csi-miR827的相对表达量随着果实粒化级别的增加而减少,且差异显著(P<0.05),同时表达量与甜橙的粒化级别显著相关,其相关系数分别达到了0.886,0.888,0.944和0.896。其中N-miR159a3p和N-miR828为预测得到的柑橘中未报道的候选miRNA,csi-miR397和csi-miR827为已报道的柑橘miRNA。5.通过测定不同粒化级别果实中木质素及磷元素的含量发现,木质素和磷元素与粒化级别具有显著相关性,其相关系数分别为0.972和0.960。运用qRT-PCR对csi-miR397的靶基因Cs6g06890.1,N-miR828的靶基因Cs1g17590.1的相对表达量测定后进行相关性分析,结果表明靶基因的相对表达量与各自miRNA的表达量,粒化程度,木质素的含量均显著相关。故csi-miR397,N-miR828可能是通过csi-miR397/Cs6g06890.1和N-miR828/Cs1g17590.1模式来调控木质素的合成从而达到对汁胞粒化调控的目的。而csi-miR827的靶基因Cs5g10180.1的相对表达量则与miR827的表达量,果实粒化级别及磷含量均显著相关。csi-miR827通过调控磷转运蛋白Cs5g10180.1来调控磷元素在柑橘体内的平衡,而磷元素具有对细胞中水分保持的功能,故csi-miR397/Cs6g06890.1模式可能通过影响汁胞中水分的转移来对柑橘果实的汁胞粒化进行调控。
其他文献
为了探讨诺丽果汁对过氧化氢诱导的PC12细胞氧化损伤的保护作用,本试验采用H2O2造成PC12神经细胞氧化损伤模型,通过荧光显微镜观察细胞形态,MTT测定细胞存活率、乳酸脱氢酶(LD
文章通过采用矩阵式组织结构和以工作流引擎为基础的流程管理系统,将项目管理与柔性流程相结合,在应对各类不确定性因素、满足客户差异化需求的同时,充分利用流程管理能高效
论述了化肥厂塔器改造中改造技术的选用原则,并介绍了各岗位可供选择的领先技术,提出了改造的运作上应该注意的几点问题。
<正>乳腺疾病是女性发病率较高的一系列疾病,《妇科玉尺.妇女杂病》曰:"妇女之疾,关系最钜者,则莫如乳。"中医认为引起乳腺疾病的常见病机有正气亏虚、阳气不足、阳虚痰瘀、
用振孔高喷进行桩墙施工,将钻灌工艺有机的衔接在一起,振动回转成孔,提钻即可旋喷(也可设制为摆喷或定喷),彻底改变了普通高压旋喷的钻灌脱节施工工艺,是一种真正意义上钻灌
“‘不见面审批’背后是政府服务观念的转变和服务意识的提升”“这样的政务新风,让人点赞”……深圳首批百个“不见面审批”服务事项的上线,引发市民热议。他们纷纷表示,该项改
报纸
<正> 凡是尿路内有真性细菌尿者,即可诊断为尿路感染,真性细菌尿的定义为①膀胱穿刺尿定性培养有细菌,②导尿定量培养>10~5/毫升,或清洁中段尿定量培养>10~5/毫升,但如临床上
<正>随着市场经济的发展和人民生活水平的提高,我国畜牧业取得了巨大的发展成就。在畜牧养殖的实际过程中,存在诸多动物疾病,严重影响了畜牧养殖动物的健康和畜牧养殖业的经
强公司的标准:追求高质量,讲求客户总拥有成本最低,抓住市场主导机会,创建可组合的人才结构,寻求利益相关者的价值体验,发挥跨职能集成运营优势。
新生儿黄疸为新生儿科常见疾病之一,可分为生理性黄疸和病理性黄疸。本文对目前中西医结合治疗新生儿黄疸的研究现状进行综述,对其科学性、可行性、 实用性全面分析以期为今