新疆泥火山微生物学多样性研究

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为了解新疆乌苏泥火山嗜盐放线菌及其产酶功能多样性,用可培养方法对新疆泥火山样品中的嗜盐放线菌与细菌进行了初步研究。分别采用含有5%与10% NaCl的5种分离培养基,稀释平板涂布法对泥火山土壤样品进行分离;利用五种筛选培养基定性检测了五酶活性;在形态特征、耐盐性实验及16S rRNA基因测序的基础上进行了微生物系统发育学分析。获得嗜盐放线菌43株,极端嗜盐放线菌3株。4株嗜盐放线菌产脂肪酶,30株产半乳糖苷酶,27株产淀粉酶,6株产酯酶,4株产纤维素,1株同时产生四种酶。系统发育学分析结果表明其中29株放线菌为拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),1株为链霉菌属(Streptomyces)。产两种酶的菌株10006与Nocardiopsis exhalans(AY03600)相似性为96.64% (小于97%),可能是潜在的新种。所分离到的细菌分别归属于葡萄球菌属(Staphylococcus),嗜盐嗜碱菌属(Alkalibacterium),动性球菌属(Planococcus),短状杆菌属(Brachybacterium),海杆菌属(Marinobacter),盐单胞菌属(Halomonas),盐水球菌属(Salinicoccus),涅斯捷连科氏菌属(Nesterenkonia),芽孢杆菌属(Bacillus)。用非培养方法对新疆泥火山环境中微生物多样性进行了初步研究。从新疆泥火山样品中直接提取总DNA,构建了含150个有效转化子的泥火山细菌16S rRNA基因文库,得到的转化子经菌液PCR及HaeⅢ酶切获得16个不同带型,克隆测序结果表明,其分属于16个不同的分类单元。大部分序列与已知细菌类群的16S rDNA序列相似性较高,归属变形菌门(Proteobacteria),厚壁菌门(Firmicutes),梭杆菌门(Fusobacteria),放线菌门(Actinobacteria),优势类群为变形菌门;部分序列与已知细菌类群的16SrDNA序列同源性较低,可能代表新的分类单位。
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