淇河鲫CuZnSOD和MnSOD基因的克隆及其对嗜水气单胞菌的响应

来源 :河南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:elvisivle
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)是生物抗氧化系统中重要的组成部分,主要用于清除体内多余的活性氧自由基,以保护机体遗传物质的完整性、细胞膜的稳定性等。水生动物由于缺乏特异性免疫,其自身天然免疫十分重要。近年来,大量研究证实SOD参与水生动物抗氧化反应。淇河鲫(Qihe crucian carp Carassius auratus)是河南省特有珍贵水产品,拥有很高的营养价值和经济价值,因此研究淇河鲫SOD基因特征及对病原菌的表达响应对于理解SOD的生物学功能具有重要意义。本研究以淇河鲫为研究对象,以淇河鲫肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增出Cu Zn SOD和Mn SOD的c DNA全长序列;采用q PCR技术分别检测了Cu Zn SOD和Mn SOD在健康淇河鲫10种器官组织中的表达情况;探究嗜水气单胞菌和LPS分别处理后淇河鲫肝、鳃、肾、脾和头肾中的表达响应;同时,采用羟胺法测定了相应酶活性变化。这些研究对于理解鱼体的抗氧化防护机制有重要意义,并为淇河鲫疾病防控提供理论依据。基于已知序列,设计引物,分别扩增淇河鲫Cu Zn SOD和Mn SOD的中间保守序列、3’端和5’端序列,经拼接后分别获得759bp和960bp两条c DNA全长序列。淇河鲫Cu Zn SOD的开放阅读框(ORF)长465 bp,编码154个氨基酸。预测淇河鲫Cu Zn SOD的分子质量为16.11KD,理论等电点为5.95。活性中心中,Cu2+结合位点为:His-47、-49,-64、-121,Zn2+结合位点为:His-64、-72、-81、Asp-84。两个Cu Zn SOD的家族标签序列:45GFHVHAFGDNT55、139GNAGGRLACGVI150。两个糖基化位点:N16、N69。此外,两个半胱氨酸C58和C147形成一个二硫键。且淇河鲫Cu Zn SOD无跨膜区与信号肽,是一种胞质Cu Zn SOD。淇河鲫Mn SOD的ORF框共675bp,编码224个氨基酸。预测其分子质量为24.87KD,理论等电点为8.28。活性中心的Mn2+结合位点为:His-52、-100、Asp-185、His-189。一个Mn SOD的家族标签序列:185DVWEHAYY192。在序列前端有26bp的线粒体靶向序列(Mitochondrial Targeting Sequence,MTS):1MLCRVGYVRRCAATLNPILGAVASKQ26。分别将两个基因的氨基酸序列在NCBI中进行BLAST比对,发现它们在不同物种中都有很强的保守性。构建系统进化树发现,淇河鲫Cu Zn SOD聚于鱼类胞质Cu Zn SOD的分支中,而淇河鲫Mn SOD聚于鱼类线粒体Mn SOD的分支中。采用q PCR技术检测淇河鲫鱼10种器官组织(肝、心、肌肉、脾、肠、皮肤、头肾、脑、肾和鳃)中Cu Zn SOD和Mn SOD的m RNA表达水平。结果显示Cu Zn SOD和Mn SOD基因在各器官组织中均有表达,且其表大量存在着差异。其中,肝中表达量最大。Cu Zn SOD m RNA在心、肌肉、脾、肠、皮肤、头肾、脑、肾和鳃中的表达量依次减少。而Mn SOD m RNA表达量有所不同,在肌肉、心脏、肠、肾脏、鳃、脑、脾和皮肤中依次减少。用嗜水气单胞菌和LPS对淇河鲫鱼进行攻毒实验,用q PCR技术检测肝、鳃、肾、脾、头肾中Cu Zn SOD和Mn SOD的m RNA在0 h、3 h、6 h、12 h、24 h及48 h六个时间点的表达变化;分别检测这五种组织中SOD在各个时间点的酶活性。结果显示,经嗜水气单胞菌和LPS处理后,Cu Zn SOD和Mn SOD基因在各器官组织中的表达在特定的时间点有响应,其变化趋势大多呈现为:表达量先上调,后下降,其中在脾和肾中出现了再次上升的现象。头肾与其他组织不同,呈现为先下降,随后上升的趋势。各组织中总SOD活性在各时间点的变化与m RNA的表达变化相似。表明淇河鲫Cu Zn SOD和Mn SOD可能被诱导表达以在抗病原菌感染的免疫反应中起着重要作用。结论:1.扩增得到淇河鲫Cu Zn SOD和Mn SOD基因的c DNA全长。其中Cu Zn SOD c DNA全长759bp编码154个氨基酸;Mn SOD c DNA全长960bp,编码224个氨基酸。2.在嗜水气单胞菌和LPS处理后,淇河鲫Cu Zn SOD和Mn SOD在器官组织中的表达和酶活与对照组相比在特定的时间点有响应,表明淇河鲫Cu Zn SOD和Mn SOD可能在淇河鲫抗病原菌感染的免疫反应中起着重要作用。
其他文献
进入21世纪以来,电子商务在国际贸易中的应用越来越广泛,不仅出现了一些电子商务巨头企业,而且传统国际贸易企业也纷纷开展电子商务活动。从我国对外贸易情况来看,电子商务的
预制装配式部分钢骨混凝土梁柱节点,相对于普通的钢骨混凝土梁柱节点,其施工周期短、节能环保等优点,能够促进中国建筑行业的可持续发展。由于国内装配式建筑研究还处于研发阶段
  随着自动化、网络化和数字化技术的快速发展,高职院校图书馆的变得越来越现代化。但"人弱、难管"的馆员队伍状况很难承担起高职图书馆内涵建设的时代重任。为此,建立一支"
装配整体式框架结构是实现建筑工业化生产方式的有效途径。该种结构形式兼有现浇结构与全预制装配式结构的优点。另外,装配整体式框架结构还具有施工效率高,经济效益好,节能
人参是五加科植物人参(Panax ginseng C.A.Meyer)的干燥根,自古以来被认为是医食同补的尚佳药用植物。历代医书中都有,人参具有大补元气、补脾益肺、生津止渴、安神增智等功效的记载。现代生物学及医学研究表明人参具有多方面的药理和生物学活性,含有多种类型的化学成分,如皂苷类、糖类、多肽类、脂肪酸、氨基酸、挥发油等。近年来,得到广泛研究的主要活性成分是人参皂苷和人参多糖。由于对天然寡糖的
  高校图书馆图书招标采购是市场经济环境下依据国家招投标法选择图书采购供应商的一种高效科学的图书采购方法。目前图书招标采购出现"低价中标"的情况,严重影响了文献资源
  以杭州西湖风景名胜区范围内分布最为广泛的香樟、银杏、枫香三种古树为研究对象,对其病虫害发生情况进行了调查,并就病虫害防治方法进行了研究,以期为进一步推动古树保护复
摘要:农村教学点是适应我国中西部农村特殊地理状况而广泛存在的教学组织形式,它切实为农村偏远地区特别是山区学生上学带来了便利,在农村教育发展中不可或缺。而随着我国农村中小布局调整的继续推进,大量的农村教学点被撤销撤并,农村教学点处境令人堪忧。本文在实地调查的基础上,分析了农村教学点的现状及其困境,并对其未来发展趋势作出展望。  关键词:农村;教学点;困境;未来发展农村教学点是适应农村地区,特别是人口
本文以代谢控制理论为指导,研究了L-色氨酸高产菌的选育及其发酵条件的优化。主要研究内容和结果如下:1.根据微生物菌株生物合成L-色氨酸代谢途径的的特性,设计了产色氨酸的细菌选择性分离筛选培养基。对从土壤分离得到的832株细菌,通过初筛和复筛,筛选到6株L-色氨酸产生菌株,并对其进行了初步分类鉴定,确定了这6株均为谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutanicum)。其中一株编号为J
  为丰富武汉市园林绿化景观效果,武汉市园林科研所从上海、杭州等地引种木香、紫叶千鸟花、黄金锦络石等50多种花灌木进行引种试验,本研究主要是通过观测引种花灌木越冬越夏