政府研究与开发(R&D)补贴是基于研究与开发市场存在的正外部性，为了降低企业研发投资成本给予企业的一种激励性财政补贴。目的是为了促进企业加大研发投入，生产更多的技术和知识，弥补市场缺陷，从而提高社会总体科技水平。但是，由于政府在制定和实行政策的过程中，政府及其官员同样作为效用最大化的机构和个人，有可能受到追求利益最大化的企业或利益集团的游说、贿赂(寻租)等的影响，甚至创租，使得政府在R&D补贴中一定程度上失灵。因此，研究政府在R&D补贴过程中政府与企业之间的关系对于判定政府R&D补贴政策的有效性有一定的现实意义。　　本文首先从理论上分析了政府R&D补贴的依据、政府R&D补贴支出中的寻租问题，阐述了政府R&D补贴支出的必要性，并说明了在我国转轨经济时期，政府在对企业进行R&D补贴时双方都有动机使寻租行为发生，且外部环境条件也有可能促成寻租行为。接着，本文以2006-2009年上市公司为研究对象，建立实证模型，验证了我国政府R&D补贴政策总体上是有效的。同时也发现，在腐败程度较高的地区，企业和政府行为会受到制度环境的影响，存在一定程度的寻租行为。进一步的研究还发现，这种寻租的问题在国有企业中表现得更为明显。据此，本文提出进一步提高政府R&D补贴效率的政策建议。这是从一个全新的角度来研究R&D市场中政府与企业之间的关系。