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目的：通过对《新疆医科大学学报》（期刊A）近10年和2009—2011年同期出版发行的另外两种医学核心期刊（期刊B、期刊C）所刊载论著的调查，了解我校学报在统计学方法应用和常见统计学问题等方面的现状，并探讨与其他医学核心期刊是否存在差异，从而有针对性地提出解决对策。方法：以2002—2011年出版发行的《新疆医科大学学报》和2009—2011另外两种核心期刊所刊载的论著作为研究对象，采用分层随机抽样的方法，随机抽取三种期刊每个出版年论著各100篇，对每篇论著的资料类型、所采用的统计软件、统计推断方法、设计类型，以及统计设计、统计描述、统计推断、结果解释常见的缺陷和错误情况进行分类统计，并对三种期刊在统计学方法应用和常见统计学问题等方面进行对比分析。同时对《新疆医科大学学报》10年间符合纳入标准的论著进行相关信息的统计，包括第一作者学历、职称及基金项目情况，分析我校学报在2002—2005年、2006—2008年、2009—2011年3个不同出版时期和在不同作者群中其论著常见统计学问题是否存在差异。结果：（1）《新疆医科大学学报》2002—2005年、2006—2008年、2009—2011年3个不同出版时期相比，论著统计分析方法应用率、设计类型、常用的统计软件种类以及统计设计缺陷率、统计分析表述缺陷率和统计结果解释缺陷率差异均具有统计学意义（χ2值分别41.053、49.368、88.005、10.575、23.144、16.302，P＜0.05或0.01），而论著资料类型、观测指标为多指标的论著比例、统计推断方法和统计描述缺陷率差异无统计学意义（P值均＞0.05）。（2）《新疆医科大学学报》2009—2011年和同期出版的另外两种医学核心期刊（期刊B、期刊C）相比，论著设计类型、常用的统计推断方法、统计设计缺陷率及部分统计描述缺陷率和统计学分析表述缺陷率差异具有统计学意义（P＜0.05或0.01），而论著的统计分析方法应用率、资料类型、观测指标为多指标的论著比例、常用的统计软件种类和统计结果解释缺陷率差异无统计学意义（P值均＞0.05）。结论：近10年《新疆医科大学学报》常见的统计学问题有明显降低的趋势，但与其他两种医学核心期刊相比仍存在较大差异。提高我校学报乃至其他医学期刊中统计方法的应用质量是一项长期而又艰巨的工作，它涉及到作者、编者、审者等多个方面，需要大家共同的努力，才能从根本上提高医学论文质量。